More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0589 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  100 
 
 		 217 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  86.57 
 
 		 217 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  73.15 
 
 		 219 aa  300  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  65.74 
 
 		 219 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  61.57 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  50.23 
 
 		 219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.01 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  47.25 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  47.25 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  43.72 
 
 		 229 aa  177  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.19 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  43.72 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.79 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  41.94 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  46.54 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  44.19 
 
 		 231 aa  168  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  45.66 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  45.12 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  44.98 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  45.93 
 
 		 223 aa  164  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  47.42 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  45.33 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  50.47 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  43.44 
 
 		 227 aa  158  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  45.21 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.48 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  45.54 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  43.38 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  43.64 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3445  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.26 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.2 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.83 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  43.72 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  41.71 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  46.07 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  46.81 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  41.51 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  44.27 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  46.23 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  41.78 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  40.28 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  46.81 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.2 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.55 
 
 		 229 aa  148  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  45.74 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  40.38 
 
 		 240 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  40.38 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2473  HAD family hydrolase  44.29 
 
 		 230 aa  141  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0237734  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  39.73 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  39.35 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  39.63 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.56 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  39.17 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  38.97 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  38.97 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.81 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  38.97 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  38.97 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.37 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  40.65 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  38.97 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  40.38 
 
 		 228 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  40.38 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  40.38 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  40.38 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  40.38 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  40.38 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  40.38 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.71 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  42.86 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.98 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  39.72 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.28 
 
 		 240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  40.47 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  36.15 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  37.44 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  36.02 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  36.15 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  41.18 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  37.09 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  38.68 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  38.68 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  38.21 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  38.21 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  38.21 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  38.21 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  37.91 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  39.81 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11460  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.09 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0237278  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  45.03 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0875  HAD family hydrolase  38.5 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  35.65 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4077  6-phosphogluconate phosphatase  35.68 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4142  6-phosphogluconate phosphatase  34.74 
 
 		 221 aa  122  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0330  HAD family hydrolase  38.01 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.27 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  39.89 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>