16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4785 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4785  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898894  normal  0.0913989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0393  hypothetical protein  94.12 
 
 		 136 aa  267  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5226  hypothetical protein  61.76 
 
 		 133 aa  174  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545011  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0330  hypothetical protein  38.17 
 
 		 133 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4900  hypothetical protein  41.22 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0328  hypothetical protein  38.93 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355398  normal  0.357964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0307  hypothetical protein  38.93 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0112  hypothetical protein  34.91 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  30.09 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  31.82 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  31.48 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  26.62 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2382  hypothetical protein  32.74 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377326  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  33.68 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  32.89 
 
 		 119 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  31.65 
 
 		 128 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>