More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2753 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
327 aa  656    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  91.13 
 
 
327 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  73.15 
 
 
327 aa  501  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  71.6 
 
 
327 aa  478  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  70.06 
 
 
327 aa  474  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  68.83 
 
 
327 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  69.44 
 
 
327 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  69.44 
 
 
327 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24770  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  72 
 
 
328 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  69.14 
 
 
327 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  68.21 
 
 
327 aa  461  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  68.52 
 
 
327 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  67.9 
 
 
327 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  67.28 
 
 
327 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  68.21 
 
 
327 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  66.05 
 
 
327 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1984  alcohol dehydrogenase  66.05 
 
 
327 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  67.9 
 
 
327 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  67.49 
 
 
345 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1602  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  66.05 
 
 
327 aa  451  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  67.28 
 
 
327 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  66.67 
 
 
327 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  66.98 
 
 
327 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  66.56 
 
 
327 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  66.67 
 
 
326 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  65.74 
 
 
327 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  64.51 
 
 
331 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  62.65 
 
 
327 aa  433  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  65.43 
 
 
327 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1204  quinone oxidoreductase  65.02 
 
 
326 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.740135  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  65.14 
 
 
328 aa  425  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  64.09 
 
 
330 aa  421  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1223  quinone oxidoreductase  63.11 
 
 
328 aa  418  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0950  quinone oxidoreductase  62.23 
 
 
327 aa  411  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1893  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  63.78 
 
 
327 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.77 
 
 
328 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  60.92 
 
 
328 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  62.73 
 
 
328 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.66 
 
 
328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2891  putative oxidoreductase protein  60.36 
 
 
338 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874963  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  61.26 
 
 
338 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  63.08 
 
 
328 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.3 
 
 
328 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.61 
 
 
325 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  60.8 
 
 
328 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2517  putative zinc-binding dehydrogenase  61.85 
 
 
326 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.145021  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.47 
 
 
329 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00543509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0728  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60.06 
 
 
325 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.43463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.23 
 
 
328 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3034  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.76 
 
 
334 aa  394  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60.36 
 
 
338 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  61.18 
 
 
328 aa  394  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2477  acyl-CoA dehydrogenase-like  63.92 
 
 
738 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193974  normal  0.0198771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  62.11 
 
 
328 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3189  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.98 
 
 
333 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  61.18 
 
 
332 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  62.11 
 
 
328 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60.68 
 
 
328 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60.87 
 
 
332 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  59.63 
 
 
326 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60.25 
 
 
334 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  58.7 
 
 
326 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  60.87 
 
 
329 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1248  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.98 
 
 
328 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  59.88 
 
 
329 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  61.73 
 
 
327 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.97 
 
 
329 aa  378  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60.19 
 
 
327 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  55.83 
 
 
330 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.89 
 
 
325 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1052  quinone oxidoreductase  56.4 
 
 
327 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0901  alcohol dehydrogenase  55.25 
 
 
327 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149382  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.79 
 
 
329 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.8 
 
 
325 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.48 
 
 
325 aa  352  7e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.4 
 
 
326 aa  351  8e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  53.09 
 
 
326 aa  350  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  56.04 
 
 
331 aa  344  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  54.94 
 
 
328 aa  342  7e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.23 
 
 
328 aa  341  9e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.24 
 
 
326 aa  340  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  51.23 
 
 
326 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  54.94 
 
 
326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  50.62 
 
 
324 aa  339  4e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  50.62 
 
 
324 aa  339  4e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2972  putative zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.16 
 
 
326 aa  338  5e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  50.62 
 
 
324 aa  339  5e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  50.31 
 
 
324 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.31 
 
 
324 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  50.31 
 
 
324 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  50.93 
 
 
326 aa  338  8e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  50.62 
 
 
326 aa  338  8e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  50.31 
 
 
324 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  50.31 
 
 
326 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  50 
 
 
324 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  50 
 
 
324 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0463  quinone oxidoreductase  50.62 
 
 
325 aa  335  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.152247  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0396  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family protein  50.62 
 
 
325 aa  335  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0467  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.4 
 
 
325 aa  334  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1200  putative quinone oxidoreductase  50.62 
 
 
325 aa  333  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  0.0860145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>