166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0958 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2736  amine oxidase  72.53 
 
 		 415 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1118  amine oxidase, flavin-containing protein  93.73 
 
 		 415 aa  822    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0958  amine oxidase, flavin-containing  100 
 
 		 415 aa  863    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4739  amine oxidase  75.42 
 
 		 415 aa  669    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3173  amine oxidase  74.46 
 
 		 415 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1068  amine oxidase  78.55 
 
 		 415 aa  694    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3017  amine oxidase  72.29 
 
 		 415 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2098  amine oxidase  71.57 
 
 		 415 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  62.47 
 
 		 416 aa  546  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2468  amine oxidase, flavin-containing  59.95 
 
 		 422 aa  503  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0462  FAD dependent oxidoreductase  59.81 
 
 		 441 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0638  hypothetical protein  58.29 
 
 		 426 aa  498  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000186691  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1168  amine oxidase  57.83 
 
 		 416 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1239  amine oxidase  58.07 
 
 		 416 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1169  amine oxidase  57.83 
 
 		 416 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  57.35 
 
 		 416 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  57.11 
 
 		 416 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  57.11 
 
 		 416 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01433  putative dehydrogenase  55.5 
 
 		 421 aa  486  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.923495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1312  amine oxidase  56.87 
 
 		 416 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2711  amine oxidase  55.8 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3381  hypothetical protein  56.14 
 
 		 416 aa  480  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003863  amine oxidase flavin-containing  54.22 
 
 		 436 aa  478  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2774  amine oxidase  56.28 
 
 		 417 aa  471  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.858792  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1328  hypothetical protein  57.82 
 
 		 423 aa  474  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3033  amine oxidase  55.82 
 
 		 422 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.567673  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01816  hypothetical protein  53.25 
 
 		 436 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3370  amine oxidase  55.42 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0814  hypothetical protein  58.65 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1482  amine oxidase  56.25 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1485  amine oxidase  52.77 
 
 		 421 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.584042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1001  amine oxidase  51.2 
 
 		 418 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.880623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1383  hypothetical protein  54.03 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0129  hypothetical protein  54.57 
 
 		 414 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1489  amine oxidase  52.05 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2098  amine oxidase  53.1 
 
 		 422 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1177  FAD dependent oxidoreductase  52.64 
 
 		 420 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.909891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2327  hypothetical protein  53.22 
 
 		 414 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1956  amine oxidase  50.36 
 
 		 425 aa  423  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.130753 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01779  dehydrogenase  49.39 
 
 		 409 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0510493  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6583  FAD dependent oxidoreductase  48.81 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0728  FAD dependent oxidoreductase  46.56 
 
 		 570 aa  398  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0404381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0739  hypothetical protein  45.23 
 
 		 570 aa  389  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1867  amine oxidase  49.29 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0490  amine oxidase:FAD dependent oxidoreductase  46.56 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.599363  normal  0.908175 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5828  amine oxidase  48.45 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1616  amine oxidase  47.46 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  47.51 
 
 		 421 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1045  FAD dependent oxidoreductase  47.46 
 
 		 433 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.687688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2971  FAD dependent oxidoreductase  47.21 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2398  FAD dependent oxidoreductase  47.21 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6096  FAD dependent oxidoreductase  45.89 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0754929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3433  putative dehydrogenase  46.49 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0273  amine oxidase  47.46 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1176  amine oxidase  40.43 
 
 		 577 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1390  amine oxidase  47.12 
 
 		 445 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0236  putative dehydrogenase  46.24 
 
 		 441 aa  364  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0088  amine oxidase flavin-containing  46.23 
 
 		 435 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1053  FAD dependent oxidoreductase  47.1 
 
 		 457 aa  364  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2253  amine oxidase  44.79 
 
 		 451 aa  363  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1449  amine oxidase  45.73 
 
 		 434 aa  361  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3930  hypothetical protein  46.12 
 
 		 437 aa  362  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1622  amine oxidase  46.27 
 
 		 443 aa  358  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2556  FAD dependent oxidoreductase  44.94 
 
 		 437 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108905  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2567  amine oxidase  46.59 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2904  amine oxidase  46.35 
 
 		 437 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1443  amine oxidase  46.15 
 
 		 443 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4842  amine oxidase  45.8 
 
 		 458 aa  352  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.265562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0723  amine oxidase  44.58 
 
 		 461 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.885481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1555  amine oxidase  45.28 
 
 		 445 aa  347  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.5068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2840  amine oxidase  45.02 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167776  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0462  amine oxidase  44.73 
 
 		 439 aa  345  8e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1890  amine oxidase  44.36 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3571  amine oxidase  44.1 
 
 		 461 aa  339  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.689303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1971  amine oxidase  42.51 
 
 		 462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2025  amine oxidase  45.19 
 
 		 447 aa  335  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5886  amine oxidase  43.95 
 
 		 448 aa  332  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2437  amine oxidase  42.72 
 
 		 424 aa  332  9e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1869  amine oxidase  41.35 
 
 		 462 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0911  amine oxidase  43.4 
 
 		 447 aa  327  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0350  amine oxidase  42.17 
 
 		 423 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4269  amine oxidase  41.86 
 
 		 445 aa  326  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4020  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4537  hypothetical protein  41.55 
 
 		 667 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229647  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1239  FAD dependent oxidoreductase  43.37 
 
 		 424 aa  310  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0355742  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0414  FAD dependent oxidoreductase  42.22 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308842  normal  0.291599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2919  amine oxidase  42.86 
 
 		 413 aa  310  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0298  amine oxidase  40 
 
 		 429 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2937  FAD dependent oxidoreductase  41.3 
 
 		 430 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187359  normal  0.0531334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1250  amine oxidase  39.57 
 
 		 428 aa  300  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00507419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2362  amine oxidase  40.33 
 
 		 454 aa  299  7e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0367  amine oxidase  40.59 
 
 		 434 aa  298  9e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1091  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein, flavin amine oxidase  41.06 
 
 		 430 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2754  amine oxidase  41.06 
 
 		 430 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1802  FAD dependent oxidoreductase  39.71 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000561447 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2019  predicted protein  40.53 
 
 		 877 aa  295  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0204163 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2122  amine oxidase  38.84 
 
 		 465 aa  293  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160745 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10455  hypothetical protein  38.72 
 
 		 439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0102  amine oxidase  39.81 
 
 		 465 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3583  amine oxidase  38.55 
 
 		 421 aa  272  8.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>