More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0440 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
259 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  96.91 
 
 
259 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  88.72 
 
 
257 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  88.58 
 
 
256 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  87.94 
 
 
257 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  88.33 
 
 
257 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  87.94 
 
 
257 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  83.53 
 
 
255 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  85.38 
 
 
256 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5765  hypothetical protein  83.53 
 
 
255 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45160  hypothetical protein  76.86 
 
 
256 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.83 
 
 
258 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758979  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.83 
 
 
258 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992833  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2412  ParA family protein  66.67 
 
 
263 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.67 
 
 
263 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.897303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62 
 
 
255 aa  322  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.18 
 
 
254 aa  308  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.18 
 
 
254 aa  308  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.97066  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.89 
 
 
265 aa  307  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.92 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.29 
 
 
254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.65 
 
 
259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6545  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.32 
 
 
254 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952996  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60 
 
 
254 aa  304  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2785  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.61 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.61 
 
 
254 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.61 
 
 
254 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2041  putative chromosome partitioning protein ParA, ATPase  58.1 
 
 
254 aa  297  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93461  normal  0.236522 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.5 
 
 
257 aa  295  7e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.2 
 
 
263 aa  293  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.92 
 
 
254 aa  288  8e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1454  ParA family protein  54.83 
 
 
258 aa  278  6e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00493427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  34.27 
 
 
253 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  30.36 
 
 
258 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.68 
 
 
255 aa  122  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
252 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3569  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.95 
 
 
252 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.00440484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  31.91 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.24 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  32.66 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.94 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  28.34 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.08 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  31.2 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  30.08 
 
 
275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  30.65 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  29.88 
 
 
264 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
253 aa  115  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.08 
 
 
259 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  30.63 
 
 
347 aa  115  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.08 
 
 
259 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  31.6 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.3 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.03 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  31.45 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3210  chromosome segregation ATPase  33.2 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  31.55 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.74 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.51 
 
 
253 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.38 
 
 
262 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.94 
 
 
257 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.63 
 
 
257 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.94 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.01 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.94 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.58 
 
 
256 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  31.58 
 
 
256 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  31.58 
 
 
256 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.58 
 
 
256 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  29.73 
 
 
335 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  31.58 
 
 
256 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.58 
 
 
256 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 
268 aa  112  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  29.73 
 
 
335 aa  111  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.58 
 
 
256 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  29.73 
 
 
333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  27.53 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.46 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  30.36 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.6 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.49 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.8 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.55 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.55 
 
 
253 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  29.46 
 
 
265 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  29.48 
 
 
259 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  31.58 
 
 
263 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  29.46 
 
 
265 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  28.97 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.05 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.15 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.28 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  29.84 
 
 
256 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 
304 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
251 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  29.84 
 
 
257 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.11 
 
 
256 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>