More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0029 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  76.85 
 
 		 505 aa  831    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  97.41 
 
 		 501 aa  1022    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  100 
 
 		 501 aa  1042    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  84.63 
 
 		 510 aa  905    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  77.25 
 
 		 505 aa  829    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  77.45 
 
 		 505 aa  832    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  75.7 
 
 		 503 aa  806    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  75.3 
 
 		 503 aa  793    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  77.25 
 
 		 505 aa  836    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  76.45 
 
 		 502 aa  821    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  58.33 
 
 		 513 aa  616  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  58.33 
 
 		 517 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  55.11 
 
 		 518 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  57.34 
 
 		 517 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  57.34 
 
 		 522 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  57.34 
 
 		 522 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  57.34 
 
 		 522 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  57.34 
 
 		 522 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  57.34 
 
 		 517 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  57.34 
 
 		 522 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  67.92 
 
 		 594 aa  594  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  56.06 
 
 		 511 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  56.5 
 
 		 515 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  56.32 
 
 		 512 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  55.91 
 
 		 516 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  55.91 
 
 		 516 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  56.1 
 
 		 516 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  55.91 
 
 		 516 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  55.86 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  55.86 
 
 		 511 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  51.69 
 
 		 509 aa  530  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  45.94 
 
 		 502 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  47.04 
 
 		 502 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  46.14 
 
 		 504 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  45.74 
 
 		 502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  47.89 
 
 		 503 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  46.41 
 
 		 498 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  46.34 
 
 		 501 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  44.82 
 
 		 501 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  44.82 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  45.77 
 
 		 496 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  44.99 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  44.47 
 
 		 504 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  43.85 
 
 		 520 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  31.82 
 
 		 489 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  27.79 
 
 		 482 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  29.84 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  29.35 
 
 		 476 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  30.36 
 
 		 496 aa  164  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  28.96 
 
 		 586 aa  163  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  32.16 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  29.39 
 
 		 537 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  28.46 
 
 		 523 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  29.91 
 
 		 487 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  28.17 
 
 		 526 aa  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  27.24 
 
 		 572 aa  150  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  28.69 
 
 		 497 aa  150  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  28.6 
 
 		 508 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  28.37 
 
 		 549 aa  146  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  28.73 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739264 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  27.25 
 
 		 497 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  27.25 
 
 		 497 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  27.03 
 
 		 511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  27.25 
 
 		 497 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  27.78 
 
 		 536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  27.21 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  27.58 
 
 		 499 aa  141  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  27.02 
 
 		 497 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  27.02 
 
 		 497 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  28.21 
 
 		 498 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  28.26 
 
 		 494 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  27.63 
 
 		 479 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  28.12 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  26.71 
 
 		 483 aa  136  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  29.46 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  27.38 
 
 		 518 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  27.04 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  26.56 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  26.68 
 
 		 517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  25.38 
 
 		 473 aa  133  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  26.36 
 
 		 489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  23.84 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  25.67 
 
 		 481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  23.58 
 
 		 480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  26.44 
 
 		 467 aa  131  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  26.46 
 
 		 499 aa  131  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  27.75 
 
 		 497 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  25.59 
 
 		 502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  26.02 
 
 		 514 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  26.95 
 
 		 565 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  26.84 
 
 		 526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  26.68 
 
 		 523 aa  127  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  26.92 
 
 		 497 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3181  sulfatase  25.35 
 
 		 523 aa  126  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  24.65 
 
 		 522 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  27.29 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  27.29 
 
 		 497 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  26.92 
 
 		 497 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  26.92 
 
 		 497 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  26.92 
 
 		 497 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>