42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1915 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1915  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  580  1e-164  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000228464  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2206  lipolytic enzyme, G-D-S-L  86.43 
 
 		 280 aa  510  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0148894  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  46.39 
 
 		 263 aa  254  9e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.33 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  34.31 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  32.91 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  33.19 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  32.35 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  32.35 
 
 		 235 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  32.49 
 
 		 240 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  30.68 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  32.49 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  32.35 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  32.35 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.35 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.35 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  32.35 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  32.35 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3261  hypothetical protein  29.39 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3142  hypothetical protein  30.49 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.917118  normal  0.0747759 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01055  hypothetical protein  33.62 
 
 		 217 aa  112  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.96 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  30.92 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  31.76 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  29.34 
 
 		 225 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  27.8 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  22.98 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1537  hypothetical protein  41.56 
 
 		 82 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  26.17 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  25.56 
 
 		 249 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  24.66 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.51 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  26.51 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  26.51 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  25.49 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1538  hypothetical protein  26.17 
 
 		 125 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02421  hypothetical protein  25.13 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.564426  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  24.53 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  23.45 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  23.71 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3922  GDSL family lipase  24.08 
 
 		 270 aa  42  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>