More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1555 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  100 
 
 
87 aa  184  4e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  100 
 
 
87 aa  184  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  77.01 
 
 
87 aa  152  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  51.76 
 
 
92 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  48.19 
 
 
85 aa  87.8  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  45.78 
 
 
85 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  50.59 
 
 
85 aa  84.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  50.59 
 
 
85 aa  84.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  47.73 
 
 
88 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  46.43 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  48.19 
 
 
84 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  45.78 
 
 
85 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  48.19 
 
 
84 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  49.38 
 
 
84 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  46.99 
 
 
85 aa  83.6  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  46.99 
 
 
85 aa  83.6  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  50.59 
 
 
85 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  46.99 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  51.85 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  49.38 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  48.19 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  44.58 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  46.91 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  48.28 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  42.35 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  45.78 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  43.53 
 
 
87 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  42.86 
 
 
96 aa  80.9  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  41.86 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  48.78 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  51.81 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  44.44 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  45.78 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  48.15 
 
 
115 aa  80.1  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  51.76 
 
 
86 aa  80.5  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  46.91 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  45.24 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  44.83 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  44.83 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  44.05 
 
 
87 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  50 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  45.68 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  48.15 
 
 
86 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  46.51 
 
 
87 aa  78.2  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  45.68 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  42.68 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  42.68 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  47.13 
 
 
101 aa  78.2  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  42.68 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  50.59 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  50.59 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  41.67 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  43.9 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  43.37 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  43.53 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  42.68 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  45.68 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  42.68 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  42.68 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  50.6 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  45.78 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  43.04 
 
 
83 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  45.78 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  43.04 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  44.58 
 
 
87 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  44.58 
 
 
87 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2174  glutaredoxin family protein  43.48 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  51.81 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  47.13 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  44.3 
 
 
82 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  40.48 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  47.13 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  45.78 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  45.78 
 
 
84 aa  77  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  51.19 
 
 
86 aa  76.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  42.17 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  42.7 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  45.68 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  41.98 
 
 
86 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  45.78 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  43.37 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  48.78 
 
 
83 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  50 
 
 
87 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  49.38 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  44.05 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  43.37 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  44.19 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  44.71 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2122  glutaredoxin GrxC  43.37 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  44.3 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  44.05 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  46.99 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  46.99 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  39.77 
 
 
90 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  46.99 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  44.44 
 
 
86 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  47.56 
 
 
83 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  40.24 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  41.46 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  41.67 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>