More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2073 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
246 aa  490  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0297  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  76.99 
 
 
244 aa  387  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0328  amino acid ABC transporter permease  78.3 
 
 
244 aa  386  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.43 
 
 
229 aa  272  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384644  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5892  ABC transporter permease  52.02 
 
 
231 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68080  ABC transporter permease  52.02 
 
 
231 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal  0.0204508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2252  amino acid ABC transporter permease  52.25 
 
 
232 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4913  amino acid ABC transporter permease  55.66 
 
 
231 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4485  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  46.26 
 
 
229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1430  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.26 
 
 
229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0905208  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4291  amino acid ABC transporter permease  45.37 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0310  amino acid ABC transporter permease  54.05 
 
 
231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193986  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3990  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.81 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1827  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  44.49 
 
 
229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.883387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3774  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.81 
 
 
229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134573  hitchhiker  0.00153221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2915  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.26 
 
 
229 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3570  amino acid ABC transporter permease  44.05 
 
 
229 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.906452  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4271  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.36 
 
 
231 aa  192  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000112521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4929  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.09 
 
 
231 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0205937  hitchhiker  0.0000000789331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5359  amino acid ABC transporter, permease protein  52.94 
 
 
231 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0299  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.73 
 
 
230 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0837568  normal  0.0626241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.73 
 
 
230 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016104  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0281  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  52.73 
 
 
230 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0627068  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01551  ABC transporter permease protein  41.87 
 
 
246 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2712  arginine transporter permease subunit ArtQ  41.81 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2627  arginine transporter permease subunit ArtQ  41.81 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.204375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1581  arginine transporter permease subunit ArtQ  41.81 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.05 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.524811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1093  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.15 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436853  normal  0.0653327 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2560  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.46 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.645171  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003971  arginine/ornithine ABC transporter permease protein AotQ  41.87 
 
 
246 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0889  amino acid ABC transporter, permease protein  43.17 
 
 
229 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1959  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, inner membrane component  42.28 
 
 
246 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.450154  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.09 
 
 
241 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4137  amino acid ABC transporter, permease protein  43.91 
 
 
237 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4285  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.92 
 
 
225 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0276895  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1580  histidine ABC transporter, permease protein  42.29 
 
 
229 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0987  histidine ABC transporter, permease protein  42.29 
 
 
229 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3017  histidine ABC transporter, permease protein  42.29 
 
 
229 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.606762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1247  histidine transport system permease protein  42.29 
 
 
229 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1089  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  42.29 
 
 
229 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1094  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  42.29 
 
 
229 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4625  arginine/ornithine transport protein AotQ  45.77 
 
 
229 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1654  arginine transporter permease subunit ArtQ  41.05 
 
 
246 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.571683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2377  ABC His/Glu/Gln/Arg/opine transporter, inner membrane subunit  43.75 
 
 
243 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413222  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1791  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.17 
 
 
229 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.369418  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3875  amino acid ABC transporter permease  43.04 
 
 
242 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5464  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.39 
 
 
229 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52780  arginine/ornithine transport protein AotQ  46.27 
 
 
229 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0336  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.25 
 
 
234 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4835  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.32 
 
 
240 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.137601 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1828  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  40.52 
 
 
240 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300709  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3607  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.39 
 
 
229 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488418  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4840  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
225 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  0.251621 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0696  amino acid ABC transporter permease  42.73 
 
 
229 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3796  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.5 
 
 
229 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.719623  normal  0.0561262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26230  histidine transport system permease protein  41.96 
 
 
229 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0832582  normal  0.643473 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1175  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.73 
 
 
229 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1410  histidine ABC transporter, permease protein  44.39 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157931  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4638  amino acid ABC transporter permease  43.5 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1153  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.73 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3725  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.5 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.73 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712414  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6801  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793236  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.73 
 
 
229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4287  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  42.73 
 
 
229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2927  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, innermembrane subunit  42.29 
 
 
233 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5921  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.2 
 
 
241 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.610786  normal  0.165756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1926  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.66 
 
 
228 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2129  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.29 
 
 
260 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356557  normal  0.354244 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05530  arginine transporter permease subunit ArtQ  42.51 
 
 
229 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2853  histidine transport system permease protein  42.29 
 
 
229 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2732  amino acid ABC transporter, permease protein  42.29 
 
 
229 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2791  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  42.29 
 
 
229 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001574  arginine ABC transporter permease protein ArtQ  42.51 
 
 
229 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.552599  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5101  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.71 
 
 
240 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381438  decreased coverage  0.00220155 
 
 
-
 
NC_004310  BR0953  amino acid ABC transporter, permease protein  40.17 
 
 
240 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1089  histidine ABC transporter, permease protein  43.05 
 
 
229 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.518061  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1240  histidine ABC transporter, permease protein  43.05 
 
 
229 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.842706  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1355  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  43.05 
 
 
229 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3391  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  43.61 
 
 
229 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0210  histidine ABC transporter, permease protein  43.05 
 
 
229 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0483  histidine ABC transporter, permease protein  43.05 
 
 
229 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.158807  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1440  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  43.58 
 
 
371 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1524  amino acid ABC transporter permease  45.5 
 
 
229 aa  168  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2065  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  42.06 
 
 
267 aa  168  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2832  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  41.87 
 
 
246 aa  168  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2880  arginine/ornithine transport system permease protein  47.83 
 
 
229 aa  168  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0976589  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1589  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.99 
 
 
267 aa  168  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1122  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.61 
 
 
229 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1378  arginine transporter permease subunit ArtQ  41.2 
 
 
238 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1563  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.07 
 
 
237 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.086799  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0592  arginine ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 
221 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0258675  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2236  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.61 
 
 
240 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1593  arginine transport system permease protein  43.81 
 
 
221 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1209  amino acid ABC transporter permease  45.22 
 
 
242 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.4 
 
 
232 aa  165  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2378  arginine transporter permease subunit ArtQ  44.33 
 
 
238 aa  165  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.677527  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2789  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.66 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.113989  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2567  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.39 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>