25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1680 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1680  glutaredoxin 2  100 
 
 		 125 aa  255  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1649  hypothetical protein  59.49 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.042948 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1884  glutaredoxin 2  61.64 
 
 		 102 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036544 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  36.23 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  31.08 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8328  glutaredoxin 2  36.11 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  43.75 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  43.08 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  42.19 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5693  glutaredoxin 2  38.33 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  41.54 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  36.36 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  36.76 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  34.78 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  33.77 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  34.67 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  33.77 
 
 		 84 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  37.68 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  37.5 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  33.33 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1059  hypothetical protein  38.6 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0394  glutaredoxin 2  34.72 
 
 		 83 aa  40  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0591945  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  40.62 
 
 		 79 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  34.25 
 
 		 85 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>