155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3017 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2736  amine oxidase  98.07 
 
 		 415 aa  852    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0958  amine oxidase, flavin-containing  72.29 
 
 		 415 aa  636    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3173  amine oxidase  83.37 
 
 		 415 aa  737    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2098  amine oxidase  76.63 
 
 		 415 aa  674    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1068  amine oxidase  75.18 
 
 		 415 aa  661    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3017  amine oxidase  100 
 
 		 415 aa  867    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1118  amine oxidase, flavin-containing protein  70.12 
 
 		 415 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4739  amine oxidase  69.64 
 
 		 415 aa  610  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  56.42 
 
 		 416 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  57.73 
 
 		 416 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  57.73 
 
 		 416 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  57.73 
 
 		 416 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0462  FAD dependent oxidoreductase  57.87 
 
 		 441 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1312  amine oxidase  57.49 
 
 		 416 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2711  amine oxidase  56.28 
 
 		 416 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0638  hypothetical protein  55.8 
 
 		 426 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000186691  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1239  amine oxidase  55.16 
 
 		 416 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1168  amine oxidase  54.92 
 
 		 416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1169  amine oxidase  54.92 
 
 		 416 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3381  hypothetical protein  54.11 
 
 		 416 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01433  putative dehydrogenase  52.03 
 
 		 421 aa  462  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.923495  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003863  amine oxidase flavin-containing  53.37 
 
 		 436 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1328  hypothetical protein  54.27 
 
 		 423 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01816  hypothetical protein  52.04 
 
 		 436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2468  amine oxidase, flavin-containing  54.37 
 
 		 422 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3033  amine oxidase  53.33 
 
 		 422 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.567673  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0814  hypothetical protein  56.49 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3370  amine oxidase  53.25 
 
 		 417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1485  amine oxidase  52.77 
 
 		 421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.584042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2774  amine oxidase  52.17 
 
 		 417 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.858792  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1001  amine oxidase  49.28 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.880623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2098  amine oxidase  52.86 
 
 		 422 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1482  amine oxidase  53.25 
 
 		 417 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1489  amine oxidase  53.17 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1383  hypothetical protein  51.54 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0129  hypothetical protein  54.09 
 
 		 414 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1177  FAD dependent oxidoreductase  52.54 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.909891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2327  hypothetical protein  51.98 
 
 		 414 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1956  amine oxidase  50.37 
 
 		 425 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.130753 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0739  hypothetical protein  47.01 
 
 		 570 aa  392  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0728  FAD dependent oxidoreductase  45.9 
 
 		 570 aa  392  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0404381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6583  FAD dependent oxidoreductase  48.2 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01779  dehydrogenase  48.04 
 
 		 409 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0510493  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5828  amine oxidase  49.04 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1867  amine oxidase  49.53 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0490  amine oxidase:FAD dependent oxidoreductase  47.74 
 
 		 439 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.599363  normal  0.908175 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6096  FAD dependent oxidoreductase  46.86 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0754929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3433  putative dehydrogenase  47.46 
 
 		 433 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1045  FAD dependent oxidoreductase  46.97 
 
 		 433 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.687688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0088  amine oxidase flavin-containing  47.33 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  47.98 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1053  FAD dependent oxidoreductase  48.21 
 
 		 457 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0236  putative dehydrogenase  46.82 
 
 		 441 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1449  amine oxidase  46.57 
 
 		 434 aa  359  4e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2398  FAD dependent oxidoreductase  46.87 
 
 		 434 aa  360  4e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1176  amine oxidase  40.43 
 
 		 577 aa  360  4e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2971  FAD dependent oxidoreductase  46.87 
 
 		 434 aa  359  5e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1616  amine oxidase  46.97 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1622  amine oxidase  46.27 
 
 		 443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2253  amine oxidase  44.79 
 
 		 451 aa  350  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1443  amine oxidase  45.54 
 
 		 443 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0462  amine oxidase  47.79 
 
 		 439 aa  349  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0273  amine oxidase  46 
 
 		 449 aa  348  1e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0350  amine oxidase  43.86 
 
 		 423 aa  346  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2437  amine oxidase  44.66 
 
 		 424 aa  345  7e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2556  FAD dependent oxidoreductase  44.13 
 
 		 437 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108905  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4842  amine oxidase  44.87 
 
 		 458 aa  341  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.265562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0723  amine oxidase  44.47 
 
 		 461 aa  341  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.885481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3930  hypothetical protein  43.6 
 
 		 437 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562242 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1390  amine oxidase  45.93 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1890  amine oxidase  43.37 
 
 		 433 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2567  amine oxidase  43.84 
 
 		 437 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2840  amine oxidase  44.08 
 
 		 437 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2904  amine oxidase  43.74 
 
 		 437 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5886  amine oxidase  46.35 
 
 		 448 aa  330  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1555  amine oxidase  45.28 
 
 		 445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.5068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1869  amine oxidase  42.07 
 
 		 462 aa  326  4.0000000000000003e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1971  amine oxidase  41.29 
 
 		 462 aa  325  7e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0911  amine oxidase  44.56 
 
 		 447 aa  322  5e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3571  amine oxidase  42.65 
 
 		 461 aa  318  9e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.689303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2025  amine oxidase  43.13 
 
 		 447 aa  316  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4269  amine oxidase  42.99 
 
 		 445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1239  FAD dependent oxidoreductase  43.13 
 
 		 424 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0355742  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0367  amine oxidase  42.31 
 
 		 434 aa  309  6.999999999999999e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4020  FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 		 430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4537  hypothetical protein  42.27 
 
 		 667 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229647  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2937  FAD dependent oxidoreductase  40.78 
 
 		 430 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187359  normal  0.0531334 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0298  amine oxidase  40.14 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1250  amine oxidase  40.43 
 
 		 428 aa  295  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00507419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2754  amine oxidase  40.53 
 
 		 430 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2362  amine oxidase  41.04 
 
 		 454 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1802  FAD dependent oxidoreductase  40.1 
 
 		 457 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000561447 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1091  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein, flavin amine oxidase  40.53 
 
 		 430 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0414  FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308842  normal  0.291599 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2019  predicted protein  40.53 
 
 		 877 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0204163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2919  amine oxidase  41.53 
 
 		 413 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2122  amine oxidase  38.26 
 
 		 465 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160745 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10455  hypothetical protein  39.44 
 
 		 439 aa  277  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0102  amine oxidase  38.77 
 
 		 465 aa  262  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3583  amine oxidase  37.71 
 
 		 421 aa  262  8e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>