72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2893 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2893  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 		 243 aa  487  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.582162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3551  HCOMODA decarboxylase (CmtD)  76.35 
 
 		 244 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161109  normal  0.205223 
 
 
-
 
NC_003296  RS01660  decarboxylase protein  52.47 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.552729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2138  class II aldolase/adducin family protein  36.36 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6491  putative class II aldolase/adducin-like protein  27.35 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4371  class II aldolase/adducin-like  31.05 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1062  class II aldolase/adducin family protein  36.02 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138135  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4349  class II aldolase/adducin family protein  30.04 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  31.69 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  28 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5245  class II aldolase/adducin domain protein  32.2 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5614  class II aldolase/adducin domain protein  32.2 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0752724  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0077  class II aldolase/adducin domain protein  30.99 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0421444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0208  hypothetical protein  25.5 
 
 		 236 aa  52.8  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.720455  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  30.99 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  32.17 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  30.99 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4135  class II aldolase/adducin family protein  25.45 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  31.3 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  31.3 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4438  class II aldolase/adducin domain protein  26.2 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  24.37 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1000  class II aldolase/adducin domain protein  32.73 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  32.73 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  32.73 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1957  class II aldolase/adducin domain protein  32.73 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0957  class II aldolase/adducin domain protein  32.73 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0868  class II aldolase/adducin domain protein  32.73 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0280  class II aldolase/adducin domain protein  32.73 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.594918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3663  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.18 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0849  hypothetical protein  25.89 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  25.21 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4708  class II aldolase/adducin-like  29.24 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  30.77 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  27.12 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  29.02 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4368  class II aldolase/adducin family protein  27.78 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.5996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  28.18 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  28.7 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  26.22 
 
 		 263 aa  45.4  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0451  class II aldolase/adducin domain protein  27.96 
 
 		 261 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  28.14 
 
 		 427 aa  45.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  26.7 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3215  class II aldolase/adducin family protein  25.37 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.549465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  24.89 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  26.22 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  29.57 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  25.65 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  22 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4759  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.45 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2887  class II aldolase/adducin family protein  25.49 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4669  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.33 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04027  hypothetical protein  25.33 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5714  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.45 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.792036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1684  class II aldolase/adducin-like protein  24.52 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4442  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.45 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0622  class II aldolase/adducin family protein  24.52 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1713  class II aldolase/adducin family protein  24.52 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.938397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0540  class II aldolase/adducin family protein  24.52 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1657  class II aldolase/adducin family protein  24.52 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04065  L-ribulose 5-phosphate 4-epimerase  25.33 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  24.87 
 
 		 298 aa  42.7  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0543  class II aldolase/adducin family protein  24.52 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4728  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.33 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.900627  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3173  L-fuculose phosphate aldolase  24.59 
 
 		 178 aa  42.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  26.37 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1289  hypothetical protein  29.37 
 
 		 196 aa  42  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  27.05 
 
 		 260 aa  42  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0243  class II aldolase/adducin family protein  27.75 
 
 		 226 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365034  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  22.31 
 
 		 271 aa  41.6  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  36.07 
 
 		 428 aa  42  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  28.08 
 
 		 197 aa  41.6  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>