53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3339 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2962  relaxase  75.96 
 
 		 595 aa  846    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  60.7 
 
 		 575 aa  687    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  100 
 
 		 569 aa  1172    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  52.56 
 
 		 593 aa  565  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  49.83 
 
 		 599 aa  568  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  53.04 
 
 		 615 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  52.72 
 
 		 612 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  52.11 
 
 		 616 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  51.77 
 
 		 627 aa  558  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  51.32 
 
 		 614 aa  557  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  51.26 
 
 		 615 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  45.06 
 
 		 642 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  46.2 
 
 		 634 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  49.84 
 
 		 615 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  50.41 
 
 		 680 aa  544  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  50.25 
 
 		 617 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  49.83 
 
 		 621 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  47.13 
 
 		 643 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  47.45 
 
 		 639 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  51.24 
 
 		 623 aa  513  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1387  relaxase  50 
 
 		 660 aa  514  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  46.74 
 
 		 639 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  46.93 
 
 		 631 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  36.2 
 
 		 640 aa  394  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0733  relaxase  58.19 
 
 		 318 aa  353  5e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3950  relaxase  30.9 
 
 		 624 aa  266  5e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0583286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4049  relaxase  25.74 
 
 		 560 aa  150  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3687  putative helicase  39.19 
 
 		 398 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3357  helicase/Zfx/Zfy transcription activation region domain-containing protein  24.78 
 
 		 551 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2691  protein of unknown function DUF1528  45.71 
 
 		 282 aa  134  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0709  protein of unknown function DUF1528  32.9 
 
 		 485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2772  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 		 861 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4118  relaxase  29.07 
 
 		 569 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0400  relaxase  30.34 
 
 		 570 aa  123  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361957  normal  0.0772849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51640  hypothetical protein  48.31 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000358498  hitchhiker  0.000035713 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3051  protein of unknown function DUF1528  32.88 
 
 		 478 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0065  type IV conjugative transfer system protein TraI  26.67 
 
 		 990 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4411  hypothetical protein  27.99 
 
 		 308 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2814  Relaxase  27.6 
 
 		 1096 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25110  hypothetical protein  45.65 
 
 		 97 aa  89.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5472  hypothetical protein  23.68 
 
 		 611 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0952115 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2597  relaxase  24.02 
 
 		 549 aa  71.2  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.856889 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4740  Relaxase  22.22 
 
 		 721 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2306  relaxase  24.29 
 
 		 571 aa  66.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.201735  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2994  hypothetical protein  21.86 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1550  FHA domain-containing protein  24.48 
 
 		 597 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.230045  normal  0.0300322 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2854  hypothetical protein  20.93 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4265  relaxase  30.99 
 
 		 941 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350547  normal  0.8702 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  28.36 
 
 		 326 aa  48.9  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4267  relaxase  21.14 
 
 		 642 aa  47.4  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  29.92 
 
 		 352 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  27.21 
 
 		 348 aa  45.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  27.93 
 
 		 326 aa  45.1  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>