20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1398 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1398  hypothetical protein  100 
 
 		 719 aa  1489    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1788  hypothetical protein  31.82 
 
 		 359 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0856032  hitchhiker  0.00693374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  31.21 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  23.69 
 
 		 316 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  23.59 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  24.11 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  23.33 
 
 		 314 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3215  hypothetical protein  23.88 
 
 		 457 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  23.33 
 
 		 314 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  24.42 
 
 		 314 aa  57  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  29.12 
 
 		 331 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  20.38 
 
 		 374 aa  54.3  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  29.95 
 
 		 333 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  23.63 
 
 		 346 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  22.76 
 
 		 346 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.43 
 
 		 377 aa  51.2  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  23.29 
 
 		 349 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  22.07 
 
 		 319 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  24.32 
 
 		 308 aa  44.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  25.18 
 
 		 375 aa  44.3  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>