205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3283 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03840  conserved inner membrane protein  57.47 
 
 		 577 aa  678    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0113  hypothetical protein  56.65 
 
 		 573 aa  638    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4328  hypothetical protein  58.16 
 
 		 577 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91856  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4031  sulfatase  57.64 
 
 		 577 aa  680    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2579  hypothetical protein  94.15 
 
 		 584 aa  1107    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2584  hypothetical protein  59.67 
 
 		 583 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04430  hypothetical protein  55.63 
 
 		 589 aa  649    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.117859  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3283  hypothetical protein  100 
 
 		 592 aa  1216    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4449  hypothetical protein  58.16 
 
 		 577 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03789  hypothetical protein  57.47 
 
 		 577 aa  678    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58610  hypothetical protein  70.38 
 
 		 600 aa  825    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4446  hypothetical protein  58.16 
 
 		 577 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4523  hypothetical protein  57.98 
 
 		 577 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4402  hypothetical protein  57.12 
 
 		 577 aa  676    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.256321  normal  0.491316 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4061  hypothetical protein  57.47 
 
 		 577 aa  678    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4359  hypothetical protein  58.16 
 
 		 577 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3137  hypothetical protein  93.98 
 
 		 584 aa  1103    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4441  hypothetical protein  57.47 
 
 		 577 aa  678    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5131  hypothetical protein  70.5 
 
 		 600 aa  830    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5415  hypothetical protein  57.47 
 
 		 577 aa  679    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4189  hypothetical protein  57.47 
 
 		 577 aa  678    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4494  hypothetical protein  57.29 
 
 		 577 aa  677    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0756  hypothetical protein  56.63 
 
 		 565 aa  630  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.112418 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1905  hypothetical protein  30.75 
 
 		 553 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1154  sulfatase  29.31 
 
 		 564 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.614879  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2111  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  26.15 
 
 		 571 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1039  integral membrane protein  30.52 
 
 		 575 aa  146  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015393 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0774  putative membrane-associated, metal-dependent hydrolase  28.96 
 
 		 560 aa  144  6e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000171309  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2902  sulfatase  28.44 
 
 		 553 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3401  sulfatase  29.02 
 
 		 614 aa  133  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4610  sulfatase  29 
 
 		 592 aa  130  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1777  sulfatase domain-containing protein  24.19 
 
 		 589 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1865  sulfatase  26.88 
 
 		 575 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1018  sulfatase  26.02 
 
 		 544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663871  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1711  sulfatase  27.58 
 
 		 551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155197  normal  0.648833 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0093  sulfatase  23.23 
 
 		 550 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1948  hypothetical protein  24.19 
 
 		 544 aa  113  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1874  hypothetical protein  24.19 
 
 		 544 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1454  sulfatase  24.6 
 
 		 542 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2128  sulfatase  24.28 
 
 		 549 aa  110  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04885  sulfatase domain protein  26.8 
 
 		 552 aa  110  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568838  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0236  sulfatase  25.79 
 
 		 535 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0802  sulfatase  24.79 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1296  hypothetical protein  25.34 
 
 		 545 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1387  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  28.39 
 
 		 549 aa  107  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3923  hypothetical protein  26.69 
 
 		 547 aa  106  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0471  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  26.45 
 
 		 555 aa  106  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4592  hypothetical protein  24.86 
 
 		 545 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1916  sulfatase  24.78 
 
 		 545 aa  105  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.725859  normal  0.322218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1562  sulfatase  27.65 
 
 		 558 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0048353  hitchhiker  0.00604368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0024  hypothetical protein  23.2 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454428  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1318  integral membrane protein  21.82 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0042  hypothetical protein  23.2 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.281715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0039  hypothetical protein  23.2 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0039  hypothetical protein  23.2 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328486  hitchhiker  0.000197782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4122  sulfatase  25.48 
 
 		 545 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03396  predicted metal dependent hydrolase  28.78 
 
 		 563 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0166  sulfatase  28.78 
 
 		 563 aa  102  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0170  phosphoethanolamine transferase  28.78 
 
 		 563 aa  102  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03347  hypothetical protein  28.78 
 
 		 563 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3848  phosphoethanolamine transferase  28.42 
 
 		 563 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.632743  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4017  phosphoethanolamine transferase  28.42 
 
 		 563 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.363242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4916  phosphoethanolamine transferase  28.52 
 
 		 563 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3913  phosphoethanolamine transferase  28.42 
 
 		 563 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.291921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3983  phosphoethanolamine transferase  28.78 
 
 		 563 aa  102  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.449102  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3957  phosphoethanolamine transferase  28.42 
 
 		 563 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00895606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3747  phosphoethanolamine transferase  28.78 
 
 		 563 aa  102  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4041  phosphoethanolamine transferase  28.78 
 
 		 563 aa  102  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3835  phosphoethanolamine transferase  28.42 
 
 		 563 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00912049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3867  phosphoethanolamine transferase  28.78 
 
 		 563 aa  101  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0311  putative cell division protein  23.87 
 
 		 547 aa  101  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00469316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03039  predicted hydrolase, inner membrane  25.25 
 
 		 541 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4548  putative cell division protein  24.82 
 
 		 547 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0533  sulfatase  25.25 
 
 		 547 aa  100  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4555  putative cell division protein  24.82 
 
 		 547 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4639  putative cell division protein  24.82 
 
 		 547 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.500642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02990  hypothetical protein  25.25 
 
 		 541 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0526  sulfatase  25.25 
 
 		 541 aa  100  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3365  inner membrane protein yhbX  25.25 
 
 		 541 aa  100  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00782202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3658  inner membrane protein yhbX  25.25 
 
 		 541 aa  100  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0592797  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4639  putative cell division protein  24.91 
 
 		 547 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.739605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3469  inner membrane protein yhbX  24.78 
 
 		 505 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0525732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4495  inner membrane protein yhbX  25.49 
 
 		 505 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0722596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3663  sulfatase  24.91 
 
 		 512 aa  99.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3323  hypothetical protein  26.82 
 
 		 572 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0352  membrane associated sultatease  22.5 
 
 		 551 aa  98.6  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.310824  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0141  hypothetical protein  24.26 
 
 		 502 aa  98.2  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4490  phosphoethanolamine transferase  23.14 
 
 		 559 aa  97.1  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.950688  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2500  hypothetical protein  26.65 
 
 		 573 aa  97.1  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.549124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4448  lipid A phosphoethanolamine transferase  23.06 
 
 		 545 aa  96.3  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.62439  hitchhiker  0.00124758 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1724  hypothetical protein  22.94 
 
 		 552 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0657943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1798  putative cell division protein  24.02 
 
 		 543 aa  95.9  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000435221  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6033  sulfatase  22.6 
 
 		 580 aa  95.9  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218752 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05289  lipid A phosphoethanolamine transferase  22.41 
 
 		 550 aa  95.9  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5584  hypothetical protein  26.58 
 
 		 549 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3156  hypothetical protein  24.37 
 
 		 552 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4133  phosphoethanolamine transferase  22.89 
 
 		 563 aa  94.7  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.257424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00378  putative sulfatase  25.57 
 
 		 300 aa  94.7  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0080  phosphoethanolamine transferase  22.89 
 
 		 563 aa  94.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4081  phosphoethanolamine transferase  22.89 
 
 		 563 aa  94.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>