More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2493 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0818  aldehyde dehydrogenase family protein  61.68 
 
 		 541 aa  656    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2493  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 539 aa  1105    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.442503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3443  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative  96.85 
 
 		 539 aa  1072    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.381863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2515  Aldehyde Dehydrogenase  60.3 
 
 		 539 aa  695    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2859  aldehyde dehydrogenase  57.94 
 
 		 540 aa  638    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22040  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  83.83 
 
 		 534 aa  925    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5161  aldehyde dehydrogenase  58.77 
 
 		 569 aa  661    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.664596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2936  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  86.36 
 
 		 541 aa  919    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2492  aldehyde dehydrogenase  82.46 
 
 		 541 aa  926    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149114  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4059  aldehyde dehydrogenase  58.21 
 
 		 542 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.739878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27210  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  85.23 
 
 		 541 aa  941    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2693  aldehyde dehydrogenase  58.21 
 
 		 542 aa  658    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2321  aldehyde dehydrogenase  97.59 
 
 		 539 aa  1081    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0789  aldehyde dehydrogenase  63.93 
 
 		 541 aa  711    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2271  Aldehyde Dehydrogenase  58.13 
 
 		 541 aa  669    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0315969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45780  Aldehyde dehydrogenase  84.79 
 
 		 459 aa  672    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2144  aldehyde dehydrogenase  59.55 
 
 		 546 aa  682    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1707  Aldehyde Dehydrogenase_  60.85 
 
 		 539 aa  696    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.595433  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49950  Aldehyde dehydrogenase  84.49 
 
 		 541 aa  935    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2926  aldehyde dehydrogenase  94.99 
 
 		 539 aa  1055    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1033  aldehyde dehydrogenase  63.18 
 
 		 541 aa  717    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0798  Aldehyde Dehydrogenase  56.34 
 
 		 540 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0301  gyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  58.63 
 
 		 545 aa  684    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3408  aldehyde dehydrogenase  58.58 
 
 		 542 aa  661    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.828845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5240  aldehyde dehydrogenase  58.58 
 
 		 542 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34600  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  86.73 
 
 		 541 aa  924    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.204448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2516  Aldehyde Dehydrogenase  58.81 
 
 		 541 aa  677    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1289  Aldehyde Dehydrogenase  57.76 
 
 		 541 aa  662    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.657181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3462  aldehyde dehydrogenase  58.21 
 
 		 542 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1087  aldehyde dehydrogenase  62.1 
 
 		 540 aa  679    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  55.45 
 
 		 536 aa  630  1e-179  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2068  aldehyde dehydrogenase  55.6 
 
 		 542 aa  628  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.72096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4869  aldehyde dehydrogenase  55.79 
 
 		 526 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0146679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1385  Aldehyde Dehydrogenase  55.13 
 
 		 524 aa  610  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.354292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1780  Aldehyde Dehydrogenase  56.42 
 
 		 560 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.760997 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54378  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  44 
 
 		 588 aa  416  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  33.79 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.67 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.94 
 
 		 479 aa  237  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.71 
 
 		 479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.94 
 
 		 479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  31.71 
 
 		 479 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  31.71 
 
 		 479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.71 
 
 		 479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.71 
 
 		 479 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  32.48 
 
 		 466 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.71 
 
 		 479 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.71 
 
 		 479 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  31.8 
 
 		 479 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  30.64 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.18 
 
 		 482 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  30.48 
 
 		 471 aa  218  2e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  30.48 
 
 		 482 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  30.52 
 
 		 475 aa  217  5e-55  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.12 
 
 		 475 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  30.75 
 
 		 476 aa  212  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  30.98 
 
 		 472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  31.17 
 
 		 482 aa  194  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  29.45 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  27.94 
 
 		 499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2361  aldehyde dehydrogenase  31.34 
 
 		 683 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.202698 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  29.12 
 
 		 505 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  27.56 
 
 		 498 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  32.86 
 
 		 533 aa  167  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0686  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  28.57 
 
 		 497 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000335425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  27.9 
 
 		 478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01600  putative aldehyde dehydrogenase  28.37 
 
 		 497 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510904  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  29.8 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  28.37 
 
 		 497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2080  aldehyde dehydrogenase family protein  27.83 
 
 		 479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.710123  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  31.71 
 
 		 485 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0060  succinate semialdehyde dehydrogenase  28.83 
 
 		 507 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.455704  hitchhiker  0.00355427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  29.23 
 
 		 483 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  30.05 
 
 		 455 aa  163  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3859  aldehyde dehydrogenase  29.03 
 
 		 501 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0775  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  28.12 
 
 		 497 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00425927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1454  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  28.44 
 
 		 480 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  29.6 
 
 		 482 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000636  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  30.07 
 
 		 506 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  27.29 
 
 		 477 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1629  Aldehyde Dehydrogenase  28.47 
 
 		 496 aa  162  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.67 
 
 		 480 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0679  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  27.95 
 
 		 497 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000513111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1620  aldehyde dehydrogenase  29.35 
 
 		 454 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  27.66 
 
 		 490 aa  160  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  27.83 
 
 		 502 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3822  Aldehyde Dehydrogenase  27.65 
 
 		 518 aa  160  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.959646  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  31.52 
 
 		 481 aa  160  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  30.11 
 
 		 503 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  29.39 
 
 		 482 aa  160  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  29.55 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1319  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  26.8 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  28.02 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  27.82 
 
 		 479 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  27.82 
 
 		 479 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  27.82 
 
 		 479 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3488  Aldehyde Dehydrogenase  28.02 
 
 		 489 aa  158  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0509  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (acylating)  25.81 
 
 		 491 aa  158  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0997846  normal  0.133496 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  27.82 
 
 		 479 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  31.82 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>