17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2304 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2304  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3611  hypothetical protein  90.16 
 
 		 193 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2826  hypothetical protein  88.6 
 
 		 192 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3108  hypothetical protein  90.67 
 
 		 193 aa  331  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2030  hypothetical protein  49.73 
 
 		 194 aa  155  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2165  hypothetical protein  31.25 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.700991  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  32.91 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  32.68 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0395  hypothetical protein  34.19 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.21361  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1705  hypothetical protein  31.14 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00494944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5924  hypothetical protein  30.63 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2668  hypothetical protein  33.55 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3676  hypothetical protein  31.16 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356911 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  32 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  29.03 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  27.21 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3235  hypothetical protein  24.86 
 
 		 220 aa  41.6  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.3467  normal  0.937712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>