32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3743 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3743  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  597  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00892943  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  25.21 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  22.71 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0342  ABC transporter related protein  28.44 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  25.51 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  25.1 
 
 		 246 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  23.11 
 
 		 246 aa  45.8  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  23.51 
 
 		 264 aa  45.8  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  24.45 
 
 		 281 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0891  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  24.58 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  22.43 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1710  ABC transporter related  25.82 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0483  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  23.77 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  50 
 
 		 987 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  45.9 
 
 		 561 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  24.19 
 
 		 695 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  23.14 
 
 		 455 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  48.78 
 
 		 814 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  25.56 
 
 		 323 aa  43.9  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  25.88 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  37.7 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  48.94 
 
 		 987 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2562  hypothetical protein  37.66 
 
 		 541 aa  43.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  24.3 
 
 		 374 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  24 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  25 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  25 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0579  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  23.55 
 
 		 262 aa  42.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  24.79 
 
 		 271 aa  42.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3186  ABC transporter related  33.33 
 
 		 232 aa  42.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  25 
 
 		 270 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4769  ABC transporter related  26.48 
 
 		 253 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.530136  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>