30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3335 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3335  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  100 
 
 		 127 aa  259  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3827  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  69.17 
 
 		 129 aa  168  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0251818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3743  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  68.33 
 
 		 129 aa  167  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3351  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  67.52 
 
 		 125 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000072698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1349  flagellar FlaF family protein  41.13 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0894  flagellar FlaF family protein  38.71 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.907727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1106  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  36.59 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101723  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1338  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.77 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2549  flagellar FlaF family protein  36.8 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4436  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  38.4 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5399  flagellar FlaF family protein  32.26 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3798  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  38.1 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1673  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  36.8 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1492  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.71 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.194888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5526  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  36.73 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.729878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1612  flagellar FlaF family protein  32.17 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.01474  normal  0.0137534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1893  flagellar FlaF family protein  32.17 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.524022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1625  flagellar FlaF family protein  33.91 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2856  putative flagellar protein FlaF  34.95 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2888  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  29.82 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1963  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.71 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4161  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.97 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00719827  normal  0.323743 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3879  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.15 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0660  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  35.62 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6509  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  33.8 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1114  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  41.46 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2846  hypothetical protein  27.72 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192982  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2973  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  32.43 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220628 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1119  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  31.65 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3554  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  39.02 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.849284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>