49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3051 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3051  colicin V production protein  100 
 
 		 163 aa  320  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00964388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4049  colicin V production protein  40.13 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.868969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  36.42 
 
 		 178 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3696  Colicin V production protein  42.68 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3791  Colicin V production protein  40.76 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  39.1 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1015  Colicin V production protein  46.05 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  29.8 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  28.92 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  36.92 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  35.83 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  32.71 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  26.35 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  34.45 
 
 		 173 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  26.35 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  33.11 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  26.35 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  29.56 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1144  CvpA family protein  30.6 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111431  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  30 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  34.21 
 
 		 193 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  35.25 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  34.51 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  35.96 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  32.71 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  32.71 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  31.78 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  29.8 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  31.82 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0777  colicin V production protein  29.27 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136777  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  28.04 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  26.47 
 
 		 248 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0733  Colicin V production protein  31.82 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.018844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  28.46 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  25.97 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  21.23 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  21.23 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1973  CvpA family protein  27.03 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1500  colicin V production protein  29.41 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  27.56 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  26.32 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  30.77 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  25.83 
 
 		 206 aa  42  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  32.5 
 
 		 163 aa  42  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3242  colicin V production protein  25.41 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00343248  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0367  CvpA family protein  25.23 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.202665  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  25.66 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0935  colicin V production protein  31.82 
 
 		 183 aa  41.2  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  31.67 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>