More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1531 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1531  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 
268 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.215337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2625  aspartate/glutamate/uridylate kinase  82.09 
 
 
268 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0024261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0932  putative uridylate kinase  71.27 
 
 
268 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2386  uridylate kinase  73.51 
 
 
268 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.802310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1890  aspartate/glutamate/uridylate kinase  63.67 
 
 
268 aa  353  2e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0516  aspartate/glutamate/uridylate kinase  65.56 
 
 
271 aa  349  2e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.316838  normal  0.700434 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0688  hypothetical protein  52.65 
 
 
273 aa  264  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.512522  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2454  uridylate kinase  46.77 
 
 
277 aa  249  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2394  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.42 
 
 
276 aa  227  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0277  aspartate/glutamate/uridylate kinase  45.39 
 
 
286 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.366502  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0949  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.11 
 
 
269 aa  205  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.560652  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0355  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.08 
 
 
279 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0348  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.08 
 
 
279 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2956  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.97 
 
 
270 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3843  molybdenum storage protein beta subunit  44.14 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0638  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41 
 
 
270 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1627  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.38 
 
 
270 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1574  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.46 
 
 
270 aa  192  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43210  Molybdenum storage protein beta subunit, MosB  44.3 
 
 
258 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.8 
 
 
286 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0354  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.11 
 
 
277 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0347  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.73 
 
 
277 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1693  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.08 
 
 
270 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.02 
 
 
277 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.406129  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2954  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.64 
 
 
298 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0592  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.83 
 
 
276 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.719802  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43200  Molybdenum storage protein subunit A  39.25 
 
 
276 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1626  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.2 
 
 
273 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1694  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.88 
 
 
277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0637  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.08 
 
 
277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1575  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.58 
 
 
277 aa  163  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3842  molybdenum storage protein alpha subunit  36.98 
 
 
276 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  34.03 
 
 
232 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  28.86 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12897  uridylate kinase  38.46 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5909  uridylate kinase  37.5 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.166242  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  31.33 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4124  uridylate kinase  36.54 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  37.14 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  35.24 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  28.1 
 
 
234 aa  62.4  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2844  uridylate kinase  33.98 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000917545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2110  uridylate kinase  36.19 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  37.5 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  37.5 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2049  uridylate kinase  37.5 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  36.54 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  32.69 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  33.65 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  34.62 
 
 
245 aa  59.3  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3989  uridylate kinase  36.19 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3111  uridylate kinase  35.58 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000029028  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  33.01 
 
 
242 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  25.11 
 
 
224 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2505  uridylate kinase  34.29 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.234958 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  35.85 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1721  uridylate kinase  25.31 
 
 
232 aa  57  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3648  uridylate kinase  36.19 
 
 
240 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1201  uridylate kinase  39.81 
 
 
249 aa  56.6  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000489977  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  34.26 
 
 
235 aa  57  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  33.98 
 
 
266 aa  56.6  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  33.33 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1369  uridylate kinase  33.33 
 
 
245 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  33.33 
 
 
239 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  36.45 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  34.95 
 
 
240 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1320  uridylate kinase  37.74 
 
 
240 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017232  hitchhiker  2.23199e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  34.95 
 
 
240 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  36.54 
 
 
244 aa  55.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3923  uridylate kinase  37.74 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0560874  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1006  uridylate kinase  33.33 
 
 
252 aa  55.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  32.69 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  34.95 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  32.04 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  33.98 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  33.33 
 
 
241 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  34.95 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3866  uridylate kinase  37.74 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0152776  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1386  uridylate kinase  32.38 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3676  uridylate kinase  37.74 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3566  uridylate kinase  37.74 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.077346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3584  uridylate kinase  37.74 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  33.98 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3872  uridylate kinase  37.74 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000594608  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  28.29 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3963  uridylate kinase  37.74 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0920824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  28.29 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0996  uridylate kinase  35.92 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.405084 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3837  uridylate kinase  37.74 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.33884e-62 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4959  uridylate kinase  37.38 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  33.01 
 
 
235 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  31.73 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  33.98 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1417  uridylate kinase  35.19 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  31.73 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2200  uridylate kinase  34.29 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  27.33 
 
 
225 aa  53.9  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  31.07 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  32.38 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2477  uridylate kinase  35.85 
 
 
240 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000191921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>