More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1201 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1201  uridylate kinase  100 
 
 
249 aa  501  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000489977  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  62.18 
 
 
249 aa  318  5e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  64.96 
 
 
242 aa  318  7e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  66.24 
 
 
237 aa  317  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  61.8 
 
 
251 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  61.28 
 
 
251 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  61.28 
 
 
251 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  64.66 
 
 
237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  63.4 
 
 
240 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  64.22 
 
 
237 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  60.68 
 
 
242 aa  311  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  61.97 
 
 
239 aa  309  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  62.13 
 
 
239 aa  309  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  61.34 
 
 
240 aa  309  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  63.25 
 
 
241 aa  308  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  61.54 
 
 
240 aa  308  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  62.13 
 
 
240 aa  308  8e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  62.23 
 
 
239 aa  307  9e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  61.64 
 
 
239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  61.41 
 
 
255 aa  305  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  63.68 
 
 
235 aa  305  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  59.4 
 
 
240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  60.94 
 
 
239 aa  305  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  64.22 
 
 
239 aa  304  9.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  62.55 
 
 
238 aa  304  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  60.94 
 
 
241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  60.17 
 
 
236 aa  301  6.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  60.52 
 
 
239 aa  300  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  57.2 
 
 
242 aa  299  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  61.28 
 
 
244 aa  298  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  61.02 
 
 
253 aa  298  8e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  57.63 
 
 
244 aa  297  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  60.94 
 
 
239 aa  297  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  55.93 
 
 
242 aa  296  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  58.62 
 
 
239 aa  295  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  63.03 
 
 
240 aa  295  7e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  58.8 
 
 
240 aa  294  9e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  60.26 
 
 
240 aa  293  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  60.26 
 
 
240 aa  293  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  55.7 
 
 
245 aa  292  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3923  uridylate kinase  62.13 
 
 
240 aa  290  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0560874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0259  uridylate kinase  63.56 
 
 
239 aa  290  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  58.62 
 
 
239 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3866  uridylate kinase  62.13 
 
 
240 aa  290  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0152776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3676  uridylate kinase  62.13 
 
 
240 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3566  uridylate kinase  62.13 
 
 
240 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.077346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3584  uridylate kinase  62.13 
 
 
240 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3963  uridylate kinase  62.13 
 
 
240 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0920824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3872  uridylate kinase  62.13 
 
 
240 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000594608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3837  uridylate kinase  62.13 
 
 
240 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.33884e-62 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  59.57 
 
 
237 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2477  uridylate kinase  61.7 
 
 
240 aa  289  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000191921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1320  uridylate kinase  61.7 
 
 
240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017232  hitchhiker  2.23199e-16 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  57.33 
 
 
235 aa  288  6e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  56.84 
 
 
237 aa  288  8e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  58.97 
 
 
240 aa  287  9e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  57.81 
 
 
241 aa  287  1e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  56.9 
 
 
238 aa  287  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3648  uridylate kinase  61.7 
 
 
240 aa  286  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  57.08 
 
 
241 aa  285  5.999999999999999e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  56.03 
 
 
240 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  57.58 
 
 
237 aa  284  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  54.31 
 
 
240 aa  284  8e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  57.33 
 
 
236 aa  284  8e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  57.08 
 
 
241 aa  284  9e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  57.33 
 
 
236 aa  284  9e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  57.08 
 
 
241 aa  284  9e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  56.03 
 
 
240 aa  284  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  56.84 
 
 
238 aa  284  9e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  59.57 
 
 
238 aa  284  9e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  55.84 
 
 
234 aa  284  9e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  57.38 
 
 
241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  56.28 
 
 
234 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  55.93 
 
 
242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  57.33 
 
 
239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  56.28 
 
 
234 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  56.54 
 
 
241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  58.19 
 
 
240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  57.33 
 
 
241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  54.51 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  55.56 
 
 
238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  56.03 
 
 
239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  57.45 
 
 
238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  55.84 
 
 
234 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  58.19 
 
 
235 aa  281  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  56.84 
 
 
238 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  55.17 
 
 
239 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  56.22 
 
 
237 aa  280  1e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4151  uridylate kinase  58.37 
 
 
247 aa  280  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0537318  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  59.66 
 
 
238 aa  280  1e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  55.74 
 
 
248 aa  280  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  55.79 
 
 
237 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  53.85 
 
 
245 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  55.79 
 
 
237 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  56.9 
 
 
274 aa  280  2e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  55.6 
 
 
240 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  55.7 
 
 
243 aa  278  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  55.88 
 
 
249 aa  278  7e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  54.27 
 
 
245 aa  278  7e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  57.51 
 
 
238 aa  278  8e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>