38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0309 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  825    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  37.72 
 
 
380 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  37.23 
 
 
382 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  36.05 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  35 
 
 
353 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  31.58 
 
 
365 aa  171  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  32.82 
 
 
378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  34.47 
 
 
354 aa  163  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  31.01 
 
 
356 aa  161  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  31.37 
 
 
364 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  32.16 
 
 
356 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  28.72 
 
 
363 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  32.81 
 
 
356 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  32.81 
 
 
356 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  32.81 
 
 
356 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  30.67 
 
 
374 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  29.14 
 
 
357 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  30.12 
 
 
362 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  30.34 
 
 
357 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  29.82 
 
 
361 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  29.08 
 
 
426 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  28.96 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  28.11 
 
 
375 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  28.66 
 
 
361 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  37.06 
 
 
245 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  28.57 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  27.94 
 
 
355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  27.63 
 
 
387 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  27.3 
 
 
351 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  25.73 
 
 
363 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  26.05 
 
 
363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  30.45 
 
 
281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  29.61 
 
 
394 aa  100  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  26.69 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  30.71 
 
 
349 aa  60.1  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  26.11 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0698  hypothetical protein  29.09 
 
 
248 aa  46.2  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  40.58 
 
 
85 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>