19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0209 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0209  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  586  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0264  hypothetical protein  96.94 
 
 
294 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2160  hypothetical protein  46.97 
 
 
318 aa  239  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2921  hypothetical protein  42.37 
 
 
339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3434  hypothetical protein  41.6 
 
 
339 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3731  hypothetical protein  44.19 
 
 
309 aa  205  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2612  hypothetical protein  40.31 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1889  hypothetical protein  43.02 
 
 
310 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4732  hypothetical protein  37.32 
 
 
369 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.972118  normal  0.160192 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0111  hypothetical protein  33.86 
 
 
425 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.260276 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4274  hypothetical protein  33.33 
 
 
368 aa  142  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5496  hypothetical protein  31.56 
 
 
351 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000328707  normal  0.790551 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5216  hypothetical protein  32.72 
 
 
376 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2874  hypothetical protein  28.57 
 
 
331 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0732457  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4065  hypothetical protein  30.08 
 
 
305 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1275  hypothetical protein  25.91 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0397  hypothetical protein  23.24 
 
 
342 aa  56.2  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000547863  hitchhiker  0.000221535 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6163  hypothetical protein  24.21 
 
 
355 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0408502  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4202  hypothetical protein  23.35 
 
 
355 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>