25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2532 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2532  conserved hypothetical protein; putative conserved domain  100 
 
 		 157 aa  315  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165236  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0847  hypothetical protein  58.14 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.104899  normal  0.523953 
 
 
-
 
NC_002950  PG0726  putative lipoprotein  33.03 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2566  hypothetical protein  34.45 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.237143  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7183  translation initiation factor 2 GTPase  30.16 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747071  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2475  hypothetical protein  34.26 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000341463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3745  hypothetical protein  30.77 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2550  hypothetical protein  31.58 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0362  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  30 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.994449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2921  hypothetical protein  29.82 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1934  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  29.2 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.30886  normal  0.0103146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0884  hypothetical protein  29.31 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119116 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2938  hypothetical protein  30.63 
 
 		 224 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0669  hypothetical protein  32.19 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000157853  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0844  hypothetical protein  29.31 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  decreased coverage  0.00416761 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1702  hypothetical membrane associated protein  29.7 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.641444  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0487  putative lipoprotein  29.7 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.266885  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0810  hypothetical protein  28.04 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.0921334 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3024  hypothetical protein  24.56 
 
 		 226 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.836248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3131  hypothetical protein  24.56 
 
 		 227 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.178053  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2821  hypothetical protein  29.91 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0637274  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1247  hypothetical protein  31.15 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0357  hypothetical protein  24.81 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.453478  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1208  hypothetical protein  33.65 
 
 		 254 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4764  hypothetical protein  30.09 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>