More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4176 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  68.1 
 
 		 591 aa  781    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  77.03 
 
 		 581 aa  900    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  60.41 
 
 		 592 aa  661    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  90.96 
 
 		 584 aa  1035    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  58.62 
 
 		 561 aa  659    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  57.69 
 
 		 560 aa  681    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  77.72 
 
 		 581 aa  885    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  59.07 
 
 		 559 aa  712    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  76.9 
 
 		 582 aa  875    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1155    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  89.18 
 
 		 582 aa  998    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  56.23 
 
 		 558 aa  624  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  52.16 
 
 		 559 aa  608  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  51.47 
 
 		 568 aa  592  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  46.98 
 
 		 559 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  42.21 
 
 		 544 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  39.48 
 
 		 561 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.97 
 
 		 561 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  42.39 
 
 		 544 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  38.89 
 
 		 563 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  39.83 
 
 		 561 aa  422  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  40.66 
 
 		 543 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  40.66 
 
 		 556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  40.48 
 
 		 543 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  37.87 
 
 		 560 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  37.35 
 
 		 560 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.68 
 
 		 559 aa  392  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  39.82 
 
 		 546 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  36.13 
 
 		 565 aa  369  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  39.46 
 
 		 560 aa  363  6e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1129  hypothetical protein  38.62 
 
 		 586 aa  360  5e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.68 
 
 		 559 aa  360  5e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.63 
 
 		 554 aa  352  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  32.64 
 
 		 564 aa  347  3e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  36.93 
 
 		 599 aa  347  3e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  36.13 
 
 		 558 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  35.42 
 
 		 557 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  33.85 
 
 		 556 aa  331  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.36 
 
 		 501 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  34.76 
 
 		 551 aa  327  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  35.34 
 
 		 557 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.22 
 
 		 558 aa  323  6e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  34.19 
 
 		 558 aa  320  5e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.48 
 
 		 559 aa  319  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  33.56 
 
 		 558 aa  318  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  35.86 
 
 		 562 aa  316  9e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  33.57 
 
 		 547 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4764  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.39 
 
 		 501 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  35.06 
 
 		 558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  38.76 
 
 		 556 aa  300  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  33.83 
 
 		 557 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  32.41 
 
 		 552 aa  297  3e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  32.81 
 
 		 555 aa  296  8e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  36.35 
 
 		 552 aa  294  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  33.64 
 
 		 557 aa  294  4e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.28 
 
 		 555 aa  292  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.98 
 
 		 557 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  29.12 
 
 		 558 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  35.53 
 
 		 557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  34.03 
 
 		 565 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  34.03 
 
 		 565 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  37.07 
 
 		 544 aa  278  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  36.35 
 
 		 560 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.41 
 
 		 547 aa  278  3e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.75 
 
 		 549 aa  277  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  29.57 
 
 		 537 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  31.47 
 
 		 571 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  30.95 
 
 		 559 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  29.74 
 
 		 537 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  32.3 
 
 		 585 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.54 
 
 		 553 aa  265  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  30.65 
 
 		 565 aa  264  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  31.39 
 
 		 549 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  35.09 
 
 		 558 aa  264  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.47 
 
 		 573 aa  263  8.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  32.57 
 
 		 563 aa  262  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.4 
 
 		 530 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  34.18 
 
 		 542 aa  261  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.34 
 
 		 533 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.55 
 
 		 534 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.8 
 
 		 527 aa  259  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.34 
 
 		 533 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  33.71 
 
 		 550 aa  258  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.2 
 
 		 537 aa  258  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  29.03 
 
 		 549 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5398  hypothetical protein  37.38 
 
 		 538 aa  256  9e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.61189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.93 
 
 		 509 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  30.6 
 
 		 561 aa  256  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  31.35 
 
 		 578 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  30.15 
 
 		 549 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0841  ABC-1 domain-containing protein  33.94 
 
 		 652 aa  254  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2068  ABC-1 domain protein  28.48 
 
 		 586 aa  253  9.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  29.96 
 
 		 549 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4887  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.83 
 
 		 540 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.09 
 
 		 539 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5152  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.89 
 
 		 539 aa  250  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.79 
 
 		 551 aa  249  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  30.04 
 
 		 556 aa  249  7e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5063  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.29 
 
 		 540 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2415  hypothetical protein  33.94 
 
 		 545 aa  249  8e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0766121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>