59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2378 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2378  lactoylglutathione lyase  100 
 
 		 162 aa  331  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2168  lactoylglutathione lyase  95.45 
 
 		 156 aa  306  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.71915  normal  0.221606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1139  lactoylglutathione lyase  82.8 
 
 		 158 aa  279  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0160396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2133  lactoylglutathione lyase  83.33 
 
 		 163 aa  278  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0300  lactoylglutathione lyase  82.58 
 
 		 158 aa  271  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00424343  normal  0.149575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2801  lactoylglutathione lyase  80 
 
 		 169 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2044  lactoylglutathione lyase  82.24 
 
 		 153 aa  268  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0204479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1854  lactoylglutathione lyase  81.58 
 
 		 153 aa  266  8.999999999999999e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1018  methylmalonyl-CoA epimerase  75.97 
 
 		 154 aa  255  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.898469 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0914  lactoylglutathione lyase  77.33 
 
 		 155 aa  254  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2692  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  76.32 
 
 		 153 aa  254  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3777  lactoylglutathione lyase  76.82 
 
 		 156 aa  253  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.34023  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2516  lactoylglutathione lyase  77.78 
 
 		 155 aa  252  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0928  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  74.19 
 
 		 155 aa  251  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3408  lactoylglutathione lyase  73.68 
 
 		 155 aa  243  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.67 
 
 		 158 aa  214  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46728  predicted protein  59.73 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0916  methylmalonyl-CoA epimerase  29.17 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.56 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.67 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  34.44 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  29.5 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.57 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  33.71 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  27.97 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  28.67 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.99 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  30.16 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  30.16 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  29.37 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.33 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  28.47 
 
 		 134 aa  47.4  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.23 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  25.52 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  25.87 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  25.58 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.81 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.57641 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  36.49 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.81 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  35.94 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  24.58 
 
 		 133 aa  45.1  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.33 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  25.85 
 
 		 153 aa  44.3  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  27.86 
 
 		 135 aa  44.3  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  27.46 
 
 		 134 aa  43.9  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11354  hypothetical protein  28 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  24.41 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  27.87 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2395  methylmalonyl-CoA epimerase  27.08 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.754558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1696  methylmalonyl-CoA epimerase  26.57 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019096  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  25.37 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 		 134 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.1 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2781  methylmalonyl-CoA epimerase  29.27 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1623  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 		 136 aa  41.2  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1258  methylmalonyl-CoA epimerase  27.66 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1613  glyoxalase family protein  34.04 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>