163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1573 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1573  aspartate racemase  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0521541  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0629  aspartate racemase  35.44 
 
 		 244 aa  151  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.578464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4590  aspartate racemase  33.5 
 
 		 301 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0144088  normal  0.0378027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2741  aspartate racemase  33.04 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2004  aspartate racemase  35.71 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.272891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0308  aspartate racemase  35.78 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3504  aspartate racemase  34.08 
 
 		 233 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3987  aspartate racemase  33.63 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.191158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4295  aspartate racemase  33.62 
 
 		 250 aa  134  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467897  normal  0.0102162 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1090  aspartate racemase  34.85 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3003  aspartate racemase  32.48 
 
 		 518 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.145787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4701  aspartate racemase  34.58 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0254125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4384  aspartate racemase  32.59 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1731  aspartate racemase  29.52 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0565132  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4865  aspartate racemase  35.35 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.629158  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4912  aspartate racemase  35.35 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal  0.107391 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2731  aspartate racemase  32.65 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4841  aspartate racemase  35.35 
 
 		 244 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4914  aspartate racemase  35.35 
 
 		 244 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1378  aspartate racemase  33.5 
 
 		 238 aa  118  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4766  aspartate racemase  35.35 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.782175 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1778  aspartate racemase  32.32 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1302  aspartate racemase  31.28 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00152087  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5944  aspartate racemase  30.87 
 
 		 489 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5991  aspartate racemase  33.64 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6217  aspartate racemase  29.91 
 
 		 484 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1263  aspartate racemase  33.16 
 
 		 236 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00631674  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1511  aspartate racemase  36.76 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3181  aspartate racemase  33.19 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0465  aspartate racemase  28.09 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1886  aspartate racemase  30.24 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1720  aspartate racemase  30.28 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.377946  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1405  aspartate racemase  28.38 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6736  aspartate racemase  29.73 
 
 		 497 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.973623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5339  aspartate racemase  32.03 
 
 		 487 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302098  normal  0.0375198 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1048  aspartate racemase  32.31 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.688459  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1034  aspartate racemase  32.34 
 
 		 232 aa  105  9e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00115826  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0452  aspartate racemase  33.63 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000396457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1803  aspartate racemase  26.36 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0282  aspartate racemase  28.33 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5638  aspartate racemase  31.58 
 
 		 499 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0071  aspartate racemase  30.84 
 
 		 253 aa  98.2  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.937931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2531  aspartate racemase  29.6 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4889  probable amino-acid racemase  30.88 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4873  probable amino-acid racemase  30.05 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3108  aspartate racemase  29.52 
 
 		 259 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4485  aspartate racemase  29.11 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4503  aspartate racemase  29.9 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4865  aspartate racemase family protein  29.41 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2418  aspartate racemase  28.93 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.790687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4583  aspartate racemase  31.46 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1732  aspartate racemase  29.39 
 
 		 249 aa  85.9  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000037531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4895  aspartate racemase family protein  28.43 
 
 		 225 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4736  aspartate racemase  29.68 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0374  probable amino-acid racemase  28.02 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4650  aspartate racemase family protein  29.72 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5005  aspartate racemase family protein  29.72 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1547  aspartate racemase  29.49 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2001  aspartate racemase  25.56 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3426  aspartate racemase  24.79 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1766  aspartate racemase  27.19 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2067  aspartate racemase family protein  26.11 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2223  aspartate racemase family protein  26.11 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3120  aspartate racemase family protein  25.62 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.755099  hitchhiker  0.0000148082 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2007  aspartate racemase  25.62 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2251  aspartate racemase family protein  25.62 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.85155e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1222  aspartate racemase  26 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1020  aspartate racemase  24.79 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2006  aspartate racemase  25.96 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.975999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2205  aspartate racemase family protein  25.12 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3053  aspartate racemase  25.5 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1412  aspartate racemase family protein  26.34 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193401  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1521  aspartate racemase  26.34 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00121722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2253  aspartate racemase family protein  25.96 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.159416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2335  aspartate racemase family protein  25.96 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2048  aspartate racemase  24.88 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00935047  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0370  aspartate racemase family protein  26.34 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000827408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2599  aspartate racemase  23.92 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577714  normal  0.0780411 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0550  aspartate racemase  25.49 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3404  aspartate racemase  26.16 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.568997 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0870  aspartate racemase  25 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0325955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1171  aspartate racemase  25.25 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000110091  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1530  aspartate racemase  21.57 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.204202 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2661  aspartate racemase family protein  27.09 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.561952  hitchhiker  0.0000201094 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4003  aspartate racemase  26.69 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000429712  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1970  aspartate racemase  28.06 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0053  aspartate racemase  24.06 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3160  aspartate racemase  27.46 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000632506  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1082  aspartate racemase  25.33 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1412  aspartate racemase  23.41 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1663  aspartate racemase  26.42 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.977225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0199  aspartate racemase  27.74 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0918  aspartate racemase  24.5 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.468864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4003  putative aspartate racemase  22.06 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2656  aspartate racemase family protein  26.09 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000254701 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0734  aspartate racemase  23.41 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000319838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1262  aspartate racemase  22.97 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.399281  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2199  aspartate/glutamate racemase family protein  25.24 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1908  aspartate racemase  27.27 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2728  hypothetical protein  22.54 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>