41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3692 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  744    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  80.89 
 
 		 361 aa  617  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  73.41 
 
 		 361 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  66.3 
 
 		 363 aa  491  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  66.02 
 
 		 363 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  62.88 
 
 		 356 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  62.88 
 
 		 356 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  62.88 
 
 		 356 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  61.98 
 
 		 354 aa  478  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  63.26 
 
 		 357 aa  479  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  61.77 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  59.5 
 
 		 370 aa  457  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  60 
 
 		 375 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  52.89 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  51.9 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  50.41 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  50.14 
 
 		 362 aa  364  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  46.43 
 
 		 363 aa  348  9e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  48.35 
 
 		 356 aa  347  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  49.86 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  47.09 
 
 		 365 aa  347  3e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  49.31 
 
 		 357 aa  344  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  44.88 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  44.54 
 
 		 351 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  42.7 
 
 		 378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  43.66 
 
 		 281 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  36.27 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  36.8 
 
 		 347 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  35.28 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  39.81 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  28.96 
 
 		 395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  30.57 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  51.32 
 
 		 85 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  25.6 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  28.12 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  33.9 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  27.59 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  30 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2724  hypothetical protein  28.18 
 
 		 272 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4557  hypothetical protein  32.04 
 
 		 249 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.515775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0698  hypothetical protein  31.3 
 
 		 248 aa  43.1  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>