17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0959 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0959  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  100 
 
 		 215 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60300  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  35.35 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000472809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  34.91 
 
 		 195 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2559  Tfp pilus assembly protein PilX-like  30.69 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0751732  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2884  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  30.27 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5688  hypothetical protein  29.41 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.960278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  38.18 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0849  hypothetical protein  37.7 
 
 		 547 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0861  hypothetical protein  37.7 
 
 		 547 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3428  hypothetical protein  35.71 
 
 		 541 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2943  fimbrial biogenesis protein  39.29 
 
 		 434 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.664137  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3316  hypothetical protein  35.71 
 
 		 541 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0706  hypothetical protein  35.71 
 
 		 541 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0869  PilX protein  35.94 
 
 		 177 aa  42  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  37.93 
 
 		 220 aa  42  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0850  hypothetical protein  33.93 
 
 		 542 aa  42  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0826  hypothetical protein  35.71 
 
 		 547 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>