38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0555 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0555  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  293  7e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5763  hypothetical protein  75.86 
 
 		 150 aa  224  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66450  hypothetical protein  76.55 
 
 		 150 aa  221  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1439  hypothetical protein  42.11 
 
 		 184 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5294  hypothetical protein  30.08 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  33.71 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2917  hypothetical protein  25.58 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.389629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5195  hypothetical protein  30.48 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0603598  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1324  thioesterase domain-containing protein  27.27 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.317856  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0523  hypothetical protein  26.67 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680982  hitchhiker  0.005662 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3955  thioesterase domain protein  33.68 
 
 		 313 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1855  hypothetical protein  23.4 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2124  thioesterase superfamily protein  24.59 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1327  hypothetical protein  26.05 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0436  hypothetical protein  26.67 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1791  thioesterase domain protein  26.32 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0286  thioesterase, putative  24.59 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  31.67 
 
 		 173 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  34.78 
 
 		 170 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2158  thioesterase, putative  25.56 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4418  GNAT family acetyltransferase  30.93 
 
 		 329 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0993621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4307  acetyltransferase, gnat family  30.93 
 
 		 329 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.913175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4353  GNAT family acetyltransferase  30.93 
 
 		 313 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4240  acetyltransferase, gnat family  30.93 
 
 		 329 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4262  acetyltransferase, gnat family  30.93 
 
 		 329 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  25.58 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03722  hypothetical protein  30.53 
 
 		 329 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.645417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5335  acetyltransferase, GNAT family  30.53 
 
 		 329 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.251571 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03773  putative acetyltransferase  30.53 
 
 		 329 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871645  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4273  acetyltransferase  30.53 
 
 		 313 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4130  thioesterase domain-containing protein  30.53 
 
 		 313 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.480913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4411  thioesterase/acetyltransferase domain-containing protein  30.53 
 
 		 313 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4113  acetyltransferase  30.53 
 
 		 313 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4098  thioesterase domain protein  30.53 
 
 		 313 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0274  thioesterase domain-containing protein  26.05 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0304  hypothetical protein  25.9 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4366  acetyltransferase, GNAT family  30.53 
 
 		 313 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>