76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0450 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0450  membrane protein-like protein  100 
 
 		 128 aa  257  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07020  hypothetical protein  74.22 
 
 		 128 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  74.22 
 
 		 128 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  60.63 
 
 		 127 aa  150  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  55.47 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  55.12 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  55.12 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  55.12 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0380  hypothetical protein  62.5 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4798  hypothetical protein  62.5 
 
 		 133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467764 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  55.47 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  53.12 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  48.82 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1132  hypothetical protein  48.44 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202391  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0804  hypothetical protein  51.56 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0734  putative transmembrane protein  50.78 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106149  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  44.88 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  46.77 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  46.46 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  45.67 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  45.67 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3977  membrane protein-like protein  45.16 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109107  normal  0.438253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  45.16 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  44.35 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0294  membrane protein-like protein  50 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2271  membrane protein-like  49.59 
 
 		 159 aa  94  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2647  hypothetical protein  43.09 
 
 		 153 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00167697 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0661  hypothetical protein  41.94 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850631  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0752  hypothetical protein  41.6 
 
 		 243 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1928  transmembrane protein  40.32 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2042  hypothetical protein  40.94 
 
 		 243 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0321  membrane protein-like protein  50 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0441228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1510  membrane protein-like protein  50.4 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2347  membrane protein-like protein  50.4 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0816  hypothetical protein  46.03 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0838282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3416  hypothetical protein  38.76 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0831  transmembrane protein  41.27 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2496  membrane protein-like protein  43.33 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.040419  normal  0.199912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  39.32 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  37.01 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  38.74 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  37.84 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0927  hypothetical protein  37.21 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  34.75 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  35.83 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  36.04 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  36.94 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0720  hypothetical protein  37.07 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1022  hypothetical protein  36.04 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.833543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2325  membrane protein-like protein  39.34 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1010  hypothetical protein  36.04 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  36.04 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  35.71 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3269  hypothetical protein  37.84 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3173  hypothetical protein  37.84 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0849  hypothetical protein  36.94 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  44.05 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  31.62 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3708  hypothetical protein  36.94 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2308  hypothetical protein  33.88 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868044 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2005  hypothetical protein  33.87 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4900  membrane protein-like protein  40.82 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  32 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0936  hypothetical protein  33.68 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000828174  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  36.54 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  32.65 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  32.65 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  39.47 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0588  membrane protein-like protein  48.15 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.349139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1852  hypothetical protein  33.9 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1826  hypothetical protein  33.9 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2744  hypothetical protein  34.07 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.200077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  36.56 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  29.46 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2531  hypothetical protein  43.02 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247104  normal  0.592717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>