More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1776 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1776  riboflavin kinase / FAD synthetase  100 
 
 
320 aa  643    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.143306  normal  0.170251 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0372  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  62.07 
 
 
321 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000276676  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0303  riboflavin biosynthesis protein RibF  62.3 
 
 
321 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735935  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1459  riboflavin kinase / FAD synthetase  59.69 
 
 
320 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000664763  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0370  riboflavin biosynthesis protein RibF  56.43 
 
 
321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.125476  normal  0.302876 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0405  riboflavin biosynthesis protein RibF  55.17 
 
 
321 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0771375  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04030  Riboflavin kinase / FAD synthetase  42.56 
 
 
307 aa  250  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1312  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.7 
 
 
312 aa  248  9e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1247  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.21 
 
 
308 aa  242  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1375  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.72 
 
 
308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0790  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.16 
 
 
309 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.604563 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0947  bifunctional protein: riboflavin kinase; FAD synthetase  41.02 
 
 
309 aa  226  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3549  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.67 
 
 
311 aa  224  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0799  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.75 
 
 
310 aa  222  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1762  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.6 
 
 
314 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3756  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.84 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000159125 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1388  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.13 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47229  normal  0.722394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1127  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.5 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2384  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.82 
 
 
311 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1487  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.46 
 
 
322 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.038683  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1054  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.86 
 
 
320 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000197835  hitchhiker  0.0000124783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3505  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  42.21 
 
 
314 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2972  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.77 
 
 
314 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2770  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.39 
 
 
317 aa  205  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6523  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.27 
 
 
311 aa  205  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2686  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.74 
 
 
320 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000517202  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2209  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  38.1 
 
 
306 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2437  riboflavin biosynthesis protein RibF  39 
 
 
325 aa  202  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2451  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.11 
 
 
313 aa  203  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0579  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.12 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0112657  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2517  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.18 
 
 
325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.24857  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1082  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.02 
 
 
311 aa  199  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134006  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0952  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.07 
 
 
316 aa  198  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.431648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1782  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.32 
 
 
312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0330041  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0213  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.14 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1953  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.06 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0957  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.55 
 
 
323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0600204 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2118  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.69 
 
 
352 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1290  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.06 
 
 
311 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000080021  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1061  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.84 
 
 
317 aa  194  1e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2599  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.35 
 
 
323 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4028  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.65 
 
 
338 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0492  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.04 
 
 
315 aa  193  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.196365 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0930  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.61 
 
 
308 aa  192  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0321744  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3769  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.58 
 
 
311 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1856  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  37.93 
 
 
309 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1098  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.33 
 
 
311 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2151  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.67 
 
 
330 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3260  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.53 
 
 
356 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1936  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.33 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1641  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.81 
 
 
316 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1193  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.63 
 
 
311 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000237633  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1654  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.99 
 
 
309 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0853  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  37.04 
 
 
305 aa  189  5.999999999999999e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.560676  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1739  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.13 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.614187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07880  FMN adenylyltransferase;riboflavin kinase  37.79 
 
 
307 aa  189  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4040  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.8 
 
 
322 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1649  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.16 
 
 
315 aa  188  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0987  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  36.24 
 
 
312 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0424  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.97 
 
 
330 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0188  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.75 
 
 
314 aa  188  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3182  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.51 
 
 
312 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.260327  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1658  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.61 
 
 
319 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2724  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.89 
 
 
311 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103356  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004420  riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.01 
 
 
294 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0885612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00979  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.1 
 
 
311 aa  187  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1053  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.59 
 
 
311 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1155  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.59 
 
 
311 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00349764  normal  0.220193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3533  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.98 
 
 
311 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0245  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.54 
 
 
314 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.694964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1399  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.26 
 
 
323 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.804257  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0494  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.62 
 
 
321 aa  185  7e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0648  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.54 
 
 
322 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0693294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4560  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.54 
 
 
316 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.270493  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1181  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.99 
 
 
306 aa  185  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3236  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.59 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.440094  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0709  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.73 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2486  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.11 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1120  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.59 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1416  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  40.21 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381158  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2891  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.33 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831946  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0923  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.28 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3047  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  39.24 
 
 
306 aa  183  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0533296 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3672  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.24 
 
 
318 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000331825  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1332  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.55 
 
 
323 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1358  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.55 
 
 
323 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23538  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2958  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  37.8 
 
 
311 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229832  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3137  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  37.8 
 
 
311 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00248689  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1159  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.25 
 
 
327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287136  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1273  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.11 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.609723  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1058  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.59 
 
 
311 aa  182  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3040  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  37.46 
 
 
311 aa  182  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00882094  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0907  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.64 
 
 
324 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4863  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.91 
 
 
322 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1837  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.86 
 
 
311 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16921  putative riboflavin kinase/FAD synthase  36.6 
 
 
317 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1187  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.1 
 
 
309 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0602  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.54 
 
 
316 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0839  putative riboflavin kinase/FAD synthase  36.6 
 
 
317 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.123466  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2079  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.07 
 
 
322 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>