More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1762 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1762  riboflavin biosynthesis protein RibF  100 
 
 
314 aa  637    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3505  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  76.11 
 
 
314 aa  508  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2486  riboflavin biosynthesis protein RibF  77.39 
 
 
314 aa  488  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2972  riboflavin biosynthesis protein RibF  58.8 
 
 
314 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2451  riboflavin biosynthesis protein RibF  53.55 
 
 
313 aa  344  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2151  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.63 
 
 
330 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1388  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  45.93 
 
 
322 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47229  normal  0.722394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2599  riboflavin biosynthesis protein RibF  47.56 
 
 
323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3182  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.48 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.260327  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1487  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.31 
 
 
322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.038683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2517  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.1 
 
 
325 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.24857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2686  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.3 
 
 
320 aa  248  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000517202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1627  riboflavin biosynthesis protein RibF  47.9 
 
 
323 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0987  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  40.73 
 
 
312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3756  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.63 
 
 
310 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000159125 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2234  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.07 
 
 
317 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1953  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.04 
 
 
311 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1127  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.49 
 
 
311 aa  236  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0364  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.76 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000221325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1649  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.57 
 
 
315 aa  232  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3260  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  42.95 
 
 
307 aa  232  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.853112  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1098  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.35 
 
 
311 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1082  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.74 
 
 
311 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1312  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.4 
 
 
312 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5827  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.48 
 
 
310 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1193  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.74 
 
 
311 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000237633  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2035  FMN adenylyltransferase, riboflavin kinase  41.92 
 
 
310 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3672  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.13 
 
 
318 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000331825  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2358  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.36 
 
 
309 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.154524 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1641  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.59 
 
 
316 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0923  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.22 
 
 
311 aa  222  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0461  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.85 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.890869  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1066  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.69 
 
 
315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  0.0219323 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1053  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.34 
 
 
311 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1155  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.34 
 
 
311 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00349764  normal  0.220193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3769  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.21 
 
 
311 aa  218  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07060  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  40.99 
 
 
325 aa  219  7e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1120  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.34 
 
 
311 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3236  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.34 
 
 
311 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.440094  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1058  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.01 
 
 
311 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1247  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.45 
 
 
308 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0904  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.61 
 
 
319 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3187  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  43.95 
 
 
310 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0757172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3533  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.34 
 
 
311 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1856  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  40.27 
 
 
309 aa  217  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1776  riboflavin kinase / FAD synthetase  44.6 
 
 
320 aa  217  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.143306  normal  0.170251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1054  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  41.89 
 
 
320 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000197835  hitchhiker  0.0000124783 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3585  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.19 
 
 
315 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2958  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  37.01 
 
 
311 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229832  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3137  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  37.01 
 
 
311 aa  217  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00248689  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2252  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.6 
 
 
309 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0853928  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3040  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  36.69 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00882094  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2129  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.72 
 
 
317 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0200  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.3 
 
 
313 aa  216  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3215  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.26 
 
 
308 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1290  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.77 
 
 
311 aa  215  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000080021  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1654  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.84 
 
 
309 aa  215  8e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1837  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.13 
 
 
311 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0790  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.64 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.604563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5114  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.96 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2195  normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1936  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.84 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0641  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.62 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2724  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.69 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103356  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4025  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.22 
 
 
307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0303  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.77 
 
 
321 aa  212  7e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735935  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1733  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.24 
 
 
320 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3179  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.46 
 
 
308 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0372  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  40.07 
 
 
321 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000276676  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3272  bifunctional riboflavin kinase and FMN adenylyltransferase  36.6 
 
 
310 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2161  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.49 
 
 
323 aa  210  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0689935  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1522  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.6 
 
 
315 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.332589  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0188  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.48 
 
 
314 aa  211  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2348  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.85 
 
 
324 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400291  hitchhiker  0.00462783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2891  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.57 
 
 
311 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1375  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.81 
 
 
308 aa  210  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2437  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.73 
 
 
325 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5826  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.2 
 
 
326 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575935  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0952  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.5 
 
 
316 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.431648 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1579  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.26 
 
 
315 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2653  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.54 
 
 
335 aa  209  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03031  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.93 
 
 
289 aa  209  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0128028  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0799  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.16 
 
 
310 aa  208  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14650  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  41.78 
 
 
313 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0844225  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0579  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.86 
 
 
310 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0112657  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3326  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.03 
 
 
313 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0873807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1181  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.25 
 
 
306 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6523  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.83 
 
 
311 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04030  Riboflavin kinase / FAD synthetase  34.59 
 
 
307 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23420  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  41.08 
 
 
329 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.119836 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0930  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.32 
 
 
308 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0321744  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3956  riboflavin biosynthesis protein RibF  40 
 
 
324 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2486  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.01 
 
 
333 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0510646  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1416  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  41.61 
 
 
299 aa  206  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381158  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0213  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.05 
 
 
322 aa  206  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227135  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1675  FMN adenylyltransferase  36.79 
 
 
345 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0494  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.42 
 
 
321 aa  205  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1124  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  43.2 
 
 
315 aa  205  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0503  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.91 
 
 
320 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004420  riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.41 
 
 
294 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0885612  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1782  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.74 
 
 
312 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0330041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>