More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3756 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3756  riboflavin biosynthesis protein RibF  100 
 
 
310 aa  621  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000159125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1127  riboflavin biosynthesis protein RibF  88.06 
 
 
311 aa  553  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3769  riboflavin biosynthesis protein RibF  51.32 
 
 
311 aa  296  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0245  riboflavin biosynthesis protein RibF  49.66 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.694964  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1762  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.63 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1312  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.9 
 
 
312 aa  239  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3956  riboflavin biosynthesis protein RibF  46.08 
 
 
324 aa  238  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0790  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.96 
 
 
309 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.604563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1247  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.24 
 
 
308 aa  236  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5827  riboflavin biosynthesis protein RibF  47.22 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2972  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.15 
 
 
314 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3505  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  41.08 
 
 
314 aa  228  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6523  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.54 
 
 
311 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0799  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.75 
 
 
310 aa  226  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2051  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.68 
 
 
328 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0200  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.02 
 
 
313 aa  223  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1649  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.97 
 
 
315 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1187  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  43.36 
 
 
309 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1375  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.04 
 
 
308 aa  222  8e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3549  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.45 
 
 
311 aa  221  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0930  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.36 
 
 
308 aa  221  9e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0321744  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7738  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  42.62 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3260  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  42.67 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.853112  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14650  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  42.9 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0844225  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1953  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.45 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3184  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.58 
 
 
311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.516481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1054  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  43.37 
 
 
320 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000197835  hitchhiker  0.0000124783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5114  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.34 
 
 
314 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2195  normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2129  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  43.62 
 
 
317 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00979  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.78 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2437  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.33 
 
 
325 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2348  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.76 
 
 
324 aa  216  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400291  hitchhiker  0.00462783 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04030  Riboflavin kinase / FAD synthetase  35.03 
 
 
307 aa  215  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004420  riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.69 
 
 
294 aa  215  9e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0885612  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1782  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.99 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0330041  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0461  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.99 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.890869  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1776  riboflavin kinase / FAD synthetase  41.84 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.143306  normal  0.170251 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2451  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.93 
 
 
313 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0372  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  40.07 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000276676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1650  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.89 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0904  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.33 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3326  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.39 
 
 
313 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0873807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2686  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.79 
 
 
320 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000517202  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1058  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.54 
 
 
311 aa  211  9e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1733  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.39 
 
 
320 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1159  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.85 
 
 
327 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287136  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1654  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.45 
 
 
309 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0947  bifunctional protein: riboflavin kinase; FAD synthetase  37.42 
 
 
309 aa  210  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1936  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.45 
 
 
309 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0213  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.89 
 
 
322 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227135  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0907  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.18 
 
 
324 aa  210  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2161  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.61 
 
 
323 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0689935  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3557  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  42.66 
 
 
309 aa  209  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1379  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.84 
 
 
309 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.672568  normal  0.471041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3182  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.83 
 
 
312 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.260327  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03031  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.36 
 
 
289 aa  209  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0128028  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1213  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.64 
 
 
529 aa  209  6e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0839  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.63 
 
 
323 aa  208  8e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1155  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.19 
 
 
311 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00349764  normal  0.220193 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0967  riboflavin biosynthesis protein RibF (riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase)  38.18 
 
 
328 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0303  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.83 
 
 
321 aa  207  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735935  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1053  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.19 
 
 
311 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0188  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.64 
 
 
314 aa  208  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1641  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.88 
 
 
316 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1388  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  36.16 
 
 
322 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47229  normal  0.722394 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3179  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.92 
 
 
308 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0424  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.67 
 
 
330 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3785  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  39.46 
 
 
313 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0688887 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2209  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  40.6 
 
 
306 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2517  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.44 
 
 
325 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.24857  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23420  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  40.59 
 
 
329 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.119836 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1459  riboflavin kinase / FAD synthetase  38.76 
 
 
320 aa  206  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000664763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1290  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.49 
 
 
311 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000080021  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1120  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.19 
 
 
311 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3236  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.19 
 
 
311 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.440094  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2958  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  38.54 
 
 
311 aa  205  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229832  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3137  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  38.54 
 
 
311 aa  205  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00248689  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1193  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.14 
 
 
311 aa  205  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000237633  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1337  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.49 
 
 
309 aa  205  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107929  hitchhiker  0.00108968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12799  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.06 
 
 
331 aa  205  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3040  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  38.19 
 
 
311 aa  205  9e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00882094  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3533  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.54 
 
 
311 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1082  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.16 
 
 
311 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1098  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.46 
 
 
311 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4025  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.02 
 
 
307 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1448  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.78 
 
 
316 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000276726  normal  0.276932 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2035  FMN adenylyltransferase, riboflavin kinase  40 
 
 
310 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2599  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.18 
 
 
323 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0364  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.1 
 
 
313 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000221325  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0998  riboflavin biosynthesis protein RibF (riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase)  37.5 
 
 
328 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0503  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.7 
 
 
320 aa  203  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0480  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.94 
 
 
355 aa  203  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1181  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.27 
 
 
306 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1675  FMN adenylyltransferase  37.7 
 
 
345 aa  202  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0714  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.05 
 
 
369 aa  202  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2486  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.03 
 
 
314 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3187  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  42.09 
 
 
310 aa  202  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0757172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3672  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.29 
 
 
318 aa  202  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000331825  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2358  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.2 
 
 
309 aa  202  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.154524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2384  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.82 
 
 
311 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>