164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2992 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2992  SpoVR family protein  100 
 
 		 513 aa  1083    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3527  SpoVR family protein  59.6 
 
 		 507 aa  629  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2539  SpoVR family protein  57.52 
 
 		 495 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.624214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1228  hypothetical protein  56.32 
 
 		 499 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2731  SpoVR family protein  56.32 
 
 		 499 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.792518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2637  SpoVR family protein  56.13 
 
 		 499 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0820118  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4172  SpoVR family protein  54.78 
 
 		 500 aa  593  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4653  SpoVR family protein  54.89 
 
 		 499 aa  581  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.283151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1819  SpoVR family protein  44.74 
 
 		 467 aa  458  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1158  SpoVR family protein  41.02 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1395  SpoVR family protein  37.5 
 
 		 473 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0853  stage V sporulation protein R  38.68 
 
 		 470 aa  349  6e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0857  stage V sporulation protein R  38.68 
 
 		 470 aa  348  9e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000642993 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0551  SpoVR family protein  37.45 
 
 		 475 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2004  SpoVR family protein  38.55 
 
 		 470 aa  347  4e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0822  stage V sporulation protein R  37.88 
 
 		 472 aa  346  6e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4512  stage V sporulation protein R  38.41 
 
 		 471 aa  346  6e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2208  SpoVR family protein  58.11 
 
 		 775 aa  345  8.999999999999999e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0929  stage V sporulation protein R  37.88 
 
 		 472 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0680  stage V sporulation protein R  37.68 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0668  stage V sporulation protein R  37.68 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0680  SpoVR family protein  38.21 
 
 		 471 aa  342  7e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0512  hypothetical protein  36.98 
 
 		 466 aa  342  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0646  SpoVR family protein  37.2 
 
 		 470 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0731  stage V sporulation protein R  37.47 
 
 		 472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0767  stage V sporulation protein R  37.47 
 
 		 472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1381  SpoVR family protein  55.74 
 
 		 898 aa  332  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0625  SpoVR family protein  35.57 
 
 		 416 aa  290  4e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3004  SpoVR family protein  33.83 
 
 		 459 aa  273  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0593  SpoVR family protein  32.99 
 
 		 419 aa  262  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1203  hypothetical protein  31.1 
 
 		 462 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0491  SpoVR family protein  31.84 
 
 		 462 aa  250  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.488778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2507  stage V sporulation-like protein, SpoVR  31.93 
 
 		 478 aa  237  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1539  stage V sporulation protein R  30.27 
 
 		 449 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1332  stage V sporulation protein R  30.06 
 
 		 449 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0448775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1747  SpoVR family protein  37.82 
 
 		 675 aa  213  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0832  stage V sporulation protein R  40.64 
 
 		 269 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000211556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0838  stage V sporulation protein R  40.43 
 
 		 269 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08767e-57 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3370  SpoVR family protein  37.75 
 
 		 679 aa  201  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.390423  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0029  SpoVR family protein  37.69 
 
 		 692 aa  193  6e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0800461 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2234  stage V sporulation protein R-like protein  35.41 
 
 		 680 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.43304  normal  0.276408 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0409  stage V sporulation protein R-like protein  33.88 
 
 		 672 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1708  SpoVR family protein  28.98 
 
 		 515 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0816979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2159  SpoVR family protein  28.07 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  28.69 
 
 		 532 aa  179  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  29.03 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  29.03 
 
 		 511 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  29.03 
 
 		 511 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  28.63 
 
 		 515 aa  176  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  28.4 
 
 		 516 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1720  SpoVR-like family protein  28.83 
 
 		 543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0453  SpoVR family protein  34.11 
 
 		 423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46890  SpoVR family protein  28.48 
 
 		 520 aa  173  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3343  SpoVR-like family protein  27.24 
 
 		 540 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0032  SpoVR-like family protein  28.54 
 
 		 556 aa  169  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3058  SpoVR family protein  29.37 
 
 		 519 aa  169  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  28.95 
 
 		 521 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0239  SpoVR-like family protein  26.39 
 
 		 541 aa  169  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.489745 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  28.14 
 
 		 510 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  28.14 
 
 		 510 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  28.14 
 
 		 510 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  28.14 
 
 		 510 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  28.14 
 
 		 510 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  28.48 
 
 		 511 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2215  SpoVR family protein  27.97 
 
 		 511 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155219  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1615  SpoVR family protein  28.21 
 
 		 559 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244629  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1591  SpoVR family protein  28.21 
 
 		 559 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.762696  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2329  SpoVR family protein  28.25 
 
 		 542 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851956  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0255  SpoVR-like family protein  26.19 
 
 		 541 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1135  SpoVR family protein  28.21 
 
 		 507 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1982  SpoVR family protein  27.9 
 
 		 511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1530  SpoVR family protein  28.46 
 
 		 559 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376164  normal  0.61215 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2027  SpoVR family protein  27.83 
 
 		 560 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1227  SpoVR family protein  28.57 
 
 		 578 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1689  SpoVR family protein  27.83 
 
 		 560 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0345  SpoVR family protein  27.83 
 
 		 560 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1863  SpoVR family protein  27.83 
 
 		 560 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1875  SpoVR family protein  27.83 
 
 		 560 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0816  SpoVR family protein  27.83 
 
 		 560 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563977  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  27.55 
 
 		 510 aa  167  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4807  SpoVR family protein  28.34 
 
 		 522 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.091895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1512  SpoVR family protein  27.9 
 
 		 559 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.854578  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2255  SpoVR family protein  28.46 
 
 		 576 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1623  SpoVR family protein  28.09 
 
 		 557 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296087 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01163  hypothetical protein  28.28 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  28.28 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  28 
 
 		 509 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  28.28 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000266726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4753  SpoVR family protein  28.02 
 
 		 559 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135349  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2506  SpoVR family protein  28.88 
 
 		 508 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000176707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0883  SpoVR family protein  28.8 
 
 		 516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.800321  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  28.28 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2569  SpoVR family protein  28.74 
 
 		 517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0246298  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2206  SpoVR family protein  27.68 
 
 		 505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193374  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1772  SpoVR family protein  28.68 
 
 		 508 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  28.28 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  28.28 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000395748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  28.28 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2467  SpoVR family protein  27.88 
 
 		 560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1816  SpoVR family protein  28.68 
 
 		 508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00125161  normal  0.518687 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>