More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2681 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2681  phosphofructokinase  100 
 
 		 457 aa  936    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  33.15 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  33.25 
 
 		 348 aa  160  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  33.24 
 
 		 320 aa  154  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  32.6 
 
 		 319 aa  153  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  32.05 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  32.97 
 
 		 319 aa  150  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  31.61 
 
 		 331 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002222  6-phosphofructokinase  32.68 
 
 		 320 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278288  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  30.89 
 
 		 320 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  30.62 
 
 		 320 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  33.97 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  33.24 
 
 		 319 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  33.24 
 
 		 319 aa  146  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  32.97 
 
 		 319 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  32.97 
 
 		 319 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  32.97 
 
 		 319 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  32.97 
 
 		 319 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  32.97 
 
 		 319 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  32.97 
 
 		 319 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  32.97 
 
 		 319 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2773  6-phosphofructokinase  31.62 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00187778  normal  0.467717 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1164  6-phosphofructokinase  31.32 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00769395  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1316  6-phosphofructokinase  31.52 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  30.7 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  31.61 
 
 		 321 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  30.71 
 
 		 321 aa  143  6e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  32.42 
 
 		 341 aa  143  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  29.24 
 
 		 335 aa  143  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  31.89 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  30.85 
 
 		 341 aa  143  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0940  6-phosphofructokinase  31.75 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  32.15 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4279  6-phosphofructokinase  30.79 
 
 		 320 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  30.73 
 
 		 320 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  30.79 
 
 		 320 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.415837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  32.54 
 
 		 341 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4308  6-phosphofructokinase  30.79 
 
 		 320 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4460  6-phosphofructokinase  30.79 
 
 		 320 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.430831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  30.79 
 
 		 320 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  29.73 
 
 		 365 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1595  6-phosphofructokinase  29.92 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  28.68 
 
 		 341 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  31.97 
 
 		 361 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  30.85 
 
 		 320 aa  140  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  31.03 
 
 		 364 aa  140  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4056  6-phosphofructokinase  29.59 
 
 		 320 aa  139  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.781005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  31.51 
 
 		 341 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  29.55 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  30.23 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  28.93 
 
 		 340 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  30.34 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  29.92 
 
 		 343 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  32.69 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3812  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 		 320 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.51601  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03801  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  29.97 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4146  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  31.79 
 
 		 359 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  31.59 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1457  6-phosphofructokinase  31.68 
 
 		 340 aa  137  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0819951  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  31.68 
 
 		 327 aa  137  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  28.93 
 
 		 341 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  30.96 
 
 		 346 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4807  6-phosphofructokinase  29.32 
 
 		 320 aa  136  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  31.27 
 
 		 370 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  30.08 
 
 		 364 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1262  6-phosphofructokinase  30.56 
 
 		 322 aa  136  9e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.845469  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  30.85 
 
 		 339 aa  136  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  30.49 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0881  6-phosphofructokinase  31.51 
 
 		 319 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418501  hitchhiker  0.000000000000068965 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2794  6-phosphofructokinase  30.68 
 
 		 320 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  30.68 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  31.76 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  29.52 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  31.13 
 
 		 341 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  30.84 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1868  6-phosphofructokinase  31.48 
 
 		 319 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  31.71 
 
 		 363 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  30.85 
 
 		 342 aa  133  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0171  6-phosphofructokinase  30.45 
 
 		 320 aa  132  9e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  28.97 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  29.36 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2592  6-phosphofructokinase  29.7 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  29.36 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  29.36 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  30.03 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  29.92 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1789  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 		 322 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2135  6-phosphofructokinase  30.63 
 
 		 324 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  30.13 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  29.67 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  30.49 
 
 		 340 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  31.51 
 
 		 365 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>