120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1924 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1924  pectin acetylesterase  100 
 
 
319 aa  658    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000155025  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3062  esterase/lipase-like protein  39.94 
 
 
333 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.851787  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2213  esterase/lipase-like protein  48.59 
 
 
267 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000722209  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1345  alpha/beta hydrolase  42.03 
 
 
305 aa  218  8.999999999999998e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4918  putative esterase/lipase precursor  43.84 
 
 
299 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220535  normal  0.753644 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4266  esterase/lipase-like protein  44.66 
 
 
309 aa  215  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1902  pectin acetylesterase  37.03 
 
 
320 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2195  pectin acetylesterase  36.08 
 
 
318 aa  202  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1964  pectin acetylesterase  39.26 
 
 
308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.235642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3550  alpha/beta hydrolase  36.93 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287748  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2427  endo-1,4-beta-xylanase B  48.72 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2181  putative lipase/esterase  45.34 
 
 
258 aa  192  9e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144182 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000919  endo-1,4-beta-xylanase  40.08 
 
 
303 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  40.37 
 
 
301 aa  188  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1954  pectin acetylesterase  40.4 
 
 
308 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3552  hypothetical protein  40.48 
 
 
328 aa  185  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3975  hypothetical protein  40.07 
 
 
289 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2039  pectin acetylesterase  40.08 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.773427  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1417  esterase/lipase  44.69 
 
 
310 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.895698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1805  Esterase/lipase  42.86 
 
 
281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.90276  hitchhiker  0.0000000160109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3159  hypothetical protein  40.57 
 
 
342 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526515  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3894  esterase/lipase-like protein  40.48 
 
 
301 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2933  hypothetical protein  40.16 
 
 
342 aa  175  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0283  esterase/lipase  40.73 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3115  hypothetical protein  41.39 
 
 
342 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2905  xylanase  38.05 
 
 
333 aa  169  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.641285  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0225  pectin acetylesterase  38.98 
 
 
324 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0473386  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1292  hypothetical protein  37.02 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3038  hypothetical protein  38.98 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463751  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2001  xylanase  38.82 
 
 
301 aa  162  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0965  hypothetical protein  38.49 
 
 
337 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0088  hypothetical protein  39.75 
 
 
337 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3521  esterase/lipase-like protein  37.85 
 
 
333 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0612  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  36.3 
 
 
326 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1044  putative acetylesterase  36.3 
 
 
326 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475385  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2345  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  36.64 
 
 
417 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0855  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  36.64 
 
 
404 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1129  putative acetylesterase  35.96 
 
 
328 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4537  xylanase  34.22 
 
 
301 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664665  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  35.94 
 
 
326 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.984034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5554  xylanase  38.27 
 
 
286 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0342677 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01320  conserved hypothetical protein  37.92 
 
 
255 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000546639  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1536  hypothetical protein  37.65 
 
 
314 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1921  hypothetical protein  36.36 
 
 
327 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0188  Esterase/lipase-like protein  36.4 
 
 
346 aa  137  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.871358 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22340  esterase/lipase  39.09 
 
 
261 aa  135  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308782  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1651  hypothetical protein  34.13 
 
 
339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.744803  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3031  hypothetical protein  31.12 
 
 
293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1712  esterase/lipase-like protein  35.65 
 
 
334 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3014  acetyl esterase  34.55 
 
 
277 aa  123  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0258039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2431  endo-1,4-beta-xylanase  30.67 
 
 
291 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0212534  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2906  xylanase  31.82 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0181  hypothetical protein  30.56 
 
 
329 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.799105  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2271  alpha/beta hydrolase  32.07 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1475  esterase/lipase  34.24 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3784  hypothetical protein  32.76 
 
 
303 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000474919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0809  xylanase  34.73 
 
 
262 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1260  lipase/esterase family protein  30.59 
 
 
280 aa  102  8e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119975 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01948  xylanase  37.69 
 
 
249 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0485  esterase/lipase  32.86 
 
 
255 aa  99.8  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1216  putative esterase  27.38 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.274462  normal  0.128321 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0661  esterase/lipase-like protein  30.47 
 
 
371 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0519166  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2345  hypothetical protein  28.83 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0112  esterase/lipase  28.93 
 
 
272 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  7.81923e-16 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1562  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.39 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2516  Esterase/lipase-like protein  29.25 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228669  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1549  esterase/lipase-like protein  26.22 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0788  esterase/lipase-like  23.64 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155303  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1725  hypothetical protein  27.8 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2402  hypothetical protein  24.91 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.5 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3216  hypothetical protein  25.09 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.476052  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0810  hypothetical protein  25.68 
 
 
275 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4378  Esterase/lipase-like protein  22.37 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.84 
 
 
344 aa  59.3  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.57 
 
 
300 aa  56.2  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.86 
 
 
323 aa  54.3  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  27.85 
 
 
308 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.39 
 
 
321 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  25.15 
 
 
593 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  27.39 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  25.12 
 
 
431 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  22.73 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  27.9 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  32.26 
 
 
411 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.04 
 
 
324 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.22 
 
 
1094 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3240  hypothetical protein  23.9 
 
 
333 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.14 
 
 
324 aa  49.3  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.25 
 
 
422 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  22.77 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  26.03 
 
 
655 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  26.71 
 
 
655 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  26.03 
 
 
655 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  26.03 
 
 
654 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  26.03 
 
 
654 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3651  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.95 
 
 
373 aa  46.2  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  24.84 
 
 
318 aa  46.2  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3012  esterase, putative  32.67 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  23.5 
 
 
414 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>