271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3374 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3374  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 85 aa  176  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.096609  normal  0.701587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  63.16 
 
 		 720 aa  104  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3236  E1-E2 ATPase-associated domain-containing protein  57.32 
 
 		 344 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  57.75 
 
 		 711 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  55.84 
 
 		 709 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  55.71 
 
 		 712 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0269  heavy metal translocating P-type ATPase  53.52 
 
 		 713 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 		 722 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 793 aa  67  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  41.03 
 
 		 803 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  46.15 
 
 		 758 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 731 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  45.59 
 
 		 814 aa  57.8  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 		 718 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3796  heavy metal translocating P-type ATPase  40.96 
 
 		 756 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  48.39 
 
 		 738 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  44.74 
 
 		 844 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4117  heavy metal translocating P-type ATPase  48.28 
 
 		 731 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  44.83 
 
 		 764 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3501  heavy metal translocating P-type ATPase  43.21 
 
 		 758 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.968413 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 889 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 889 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  49.15 
 
 		 704 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  43.94 
 
 		 740 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  42.25 
 
 		 955 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 740 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 726 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  47.54 
 
 		 734 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2481  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 802 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429438  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  32.88 
 
 		 833 aa  51.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2344  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 732 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.442895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 		 904 aa  50.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 		 976 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 716 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 868 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4071  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 712 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.515155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  30.88 
 
 		 835 aa  50.1  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  36.49 
 
 		 806 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  32.88 
 
 		 751 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0551  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.76 
 
 		 768 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03318  zinc, cobalt and lead efflux system  41.94 
 
 		 732 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  38.24 
 
 		 805 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 797 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  38.24 
 
 		 805 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  41.94 
 
 		 732 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  38.24 
 
 		 805 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  38.24 
 
 		 805 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  38.24 
 
 		 805 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  38.24 
 
 		 805 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  36.49 
 
 		 806 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 744 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  39.71 
 
 		 757 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0247  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  41.94 
 
 		 732 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3752  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  41.94 
 
 		 732 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  36.25 
 
 		 797 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3853  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  41.94 
 
 		 732 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4789  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  41.94 
 
 		 732 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0512  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 		 785 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3951  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  41.94 
 
 		 732 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  39.71 
 
 		 793 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03271  hypothetical protein  41.94 
 
 		 732 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  39.71 
 
 		 832 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 857 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3106  copper-translocating P-type ATPase  38.03 
 
 		 742 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 806 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  36.21 
 
 		 760 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  33.73 
 
 		 798 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2772  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 798 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 794 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1450  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 792 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0366901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  38.24 
 
 		 805 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  31.51 
 
 		 894 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 926 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0246  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 732 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3768  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  42.65 
 
 		 732 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 832 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  32.93 
 
 		 824 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3888  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  42.65 
 
 		 732 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3948  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  42.65 
 
 		 732 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  37.04 
 
 		 799 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  34.29 
 
 		 734 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  38.81 
 
 		 739 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3778  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  42.65 
 
 		 732 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 1182 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3845  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  42.65 
 
 		 732 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 797 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3873  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  38.71 
 
 		 728 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472181  normal  0.24383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1027  (Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  37.18 
 
 		 777 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0209  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  36.76 
 
 		 771 aa  47.4  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0277781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 872 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  27.4 
 
 		 838 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 		 816 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0663  heavy metal-transporting ATPase  34.55 
 
 		 788 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0564  heavy metal-transporting ATPase  34.55 
 
 		 788 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 790 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 815 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 818 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  36.25 
 
 		 802 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 806 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>