27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0693 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0693  dienelactone hydrolase  100 
 
 
260 aa  527  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560412  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1254  dienelactone hydrolase  53.61 
 
 
277 aa  265  7e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.546126  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3206  dienelactone hydrolase  51.32 
 
 
285 aa  262  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8749  putative dienelactone hydrolase  51.16 
 
 
260 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2785  hypothetical protein  47.08 
 
 
263 aa  231  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.640406  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2009  dienelactone hydrolase family protein  48.86 
 
 
281 aa  227  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0037  dienelactone hydrolase  50 
 
 
262 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.889494  normal  0.444574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4646  hypothetical protein  43.19 
 
 
265 aa  208  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.177547  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4350  hypothetical protein  43.85 
 
 
277 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4194  hypothetical protein  43.85 
 
 
277 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668259  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4119  hypothetical protein  43.85 
 
 
277 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0781409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2068  dienelactone hydrolase  42.02 
 
 
283 aa  198  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1154  dienelactone hydrolase family protein  39.63 
 
 
261 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0699822  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  24.06 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  27.36 
 
 
263 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  25.67 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  29.2 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  26.2 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  27.68 
 
 
237 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  27.91 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  30.36 
 
 
227 aa  42.7  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  26.63 
 
 
408 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 
252 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2943  dienelactone hydrolase  25.78 
 
 
275 aa  42.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000045049  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  25.13 
 
 
259 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  31.19 
 
 
410 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  29.93 
 
 
291 aa  42  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>