20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0601 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0601  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  484  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105908  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0623  hypothetical protein  44.35 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  42.11 
 
 		 254 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0833  hypothetical protein  38.62 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.977208  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  29.11 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  29.11 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  28.99 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  27.78 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  27.39 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  27.35 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  26.84 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2049  hypothetical protein  29.77 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  28.91 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  27.13 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  30.13 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0188  permease  31.52 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  29.66 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  28.69 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2172  permease  28.37 
 
 		 177 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  26.75 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>