22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1149 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1149  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  556  1e-157  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  5.29895e-17 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0101  hypothetical protein  63.16 
 
 		 269 aa  321  8e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00117454 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0074  hypothetical protein  58.56 
 
 		 265 aa  296  3e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.85602 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0110  hypothetical protein  59.93 
 
 		 269 aa  268  7e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  27.31 
 
 		 336 aa  52.4  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  29.41 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0656  histone deacetylase superfamily protein  26.87 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000855576  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  34.19 
 
 		 336 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  27.09 
 
 		 351 aa  50.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0381  histone deacetylase superfamily protein  27.68 
 
 		 336 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0601969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4777  histone deacetylase superfamily protein  27.78 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4662  histone deacetylase family protein  26.87 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3722  histone deacetylase superfamily protein  27.09 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  32.59 
 
 		 354 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4764  histone deacetylase superfamily  27.22 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000188722  decreased coverage  0.000868257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4639  histone deacetylase superfamily protein  26.67 
 
 		 317 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000315852  hitchhiker  0.00689363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  31.71 
 
 		 357 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4295  histone deacetylase superfamily protein  25.85 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 		 393 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4918  histone deacetylase superfamily protein  26.37 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000273279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10030  histone deacetylase superfamily  26.6 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  30.07 
 
 		 372 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>