15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1596 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1596  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  319  9.000000000000001e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0754953  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0244  hypothetical protein  39.86 
 
 		 191 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0390.1  hypothetical protein  31.13 
 
 		 161 aa  87.8  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4260  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  34.01 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  33.78 
 
 		 272 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2903  hypothetical protein  29.73 
 
 		 311 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  28.97 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  30.92 
 
 		 360 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2681  hypothetical protein  28.67 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0631191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0384  hypothetical protein  26.92 
 
 		 216 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2917  hypothetical protein  29 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000650535  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3439  hypothetical protein  29 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  26.22 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  26.25 
 
 		 221 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>