40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1163 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1163  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  100 
 
 
326 aa  681    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100764  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4583  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  69.09 
 
 
325 aa  481  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5690  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  65.63 
 
 
329 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0968  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  59.56 
 
 
330 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03705  DesA1  57.14 
 
 
333 aa  388  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9316  predicted protein  46.83 
 
 
308 aa  272  4.0000000000000004e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15111  predicted protein  44.23 
 
 
329 aa  265  5.999999999999999e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.430971  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3578  fatty acid desaturase type 2  28.52 
 
 
316 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.327469  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1811  fatty acid desaturase type 2  28.23 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0307  fatty acid desaturase, type 2  26.87 
 
 
312 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1820  fatty acid desaturase, type 2  28.57 
 
 
311 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0523547  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10839  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA1  28.62 
 
 
338 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.8850299999999998e-27  hitchhiker  0.0000114549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4894  fatty acid desaturase, type 2  26.27 
 
 
331 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.688927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4144  fatty acid desaturase type 2  28.82 
 
 
333 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1903  hypothetical protein  27.97 
 
 
310 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2173  fatty acid desaturase type 2  27.31 
 
 
329 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4511  fatty acid desaturase, type 2  26.27 
 
 
331 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4598  fatty acid desaturase, type 2  26.27 
 
 
331 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4940  fatty acid desaturase, type 2  27.52 
 
 
335 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6505  fatty acid desaturase type 2  28.17 
 
 
318 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478393  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5028  fatty acid desaturase, type 2  27.52 
 
 
335 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5321  fatty acid desaturase, type 2  27.52 
 
 
335 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1668  fatty acid desaturase, type 2  27.18 
 
 
335 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5927  fatty acid desaturase, type 2  28.72 
 
 
307 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5085  fatty acid desaturase, type 2  27.63 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0992  fatty acid desaturase type 2  27.4 
 
 
321 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3918  fatty acid desaturase type 2  25.24 
 
 
330 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3535  fatty acid desaturase type 2  26.96 
 
 
329 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3536  fatty acid desaturase type 2  26.5 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1946  fatty acid desaturase type 2  24.05 
 
 
324 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2141  fatty acid desaturase type 2  25.81 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2881  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  25.1 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2162  putative acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  24.27 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1064  fatty acid desaturase type 2  26.56 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183632  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0121  fatty acid desaturase, type 2  23.92 
 
 
364 aa  56.6  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00366287  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3129  putative fatty acid desaturase  28.15 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353382  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4130  fatty acid desaturase, type 2  21.97 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4205  fatty acid desaturase, type 2  21.97 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4361  fatty acid desaturase, type 2  21.86 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11115  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA2  24.17 
 
 
275 aa  43.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00275756  normal  0.545687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>