165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3938 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3938  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  100 
 
 
249 aa  507  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450979  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4237  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  73.84 
 
 
252 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.919377  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  74.03 
 
 
252 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  72.96 
 
 
256 aa  363  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347111  normal  0.0253122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  73.16 
 
 
252 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2762  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  71.67 
 
 
256 aa  360  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05940  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  63.36 
 
 
257 aa  300  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000139676  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2787  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  49.56 
 
 
254 aa  245  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.856388  normal  0.976704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0765  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  48.12 
 
 
248 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  47.84 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  46.84 
 
 
268 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  47.71 
 
 
286 aa  242  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  47.71 
 
 
276 aa  242  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0690  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  47.41 
 
 
248 aa  240  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678233  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3020  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  47.41 
 
 
248 aa  239  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0656  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  47.41 
 
 
248 aa  239  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3039  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  47.41 
 
 
248 aa  239  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00573  periplasmic disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  47.39 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.023443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00562  hypothetical protein  47.39 
 
 
247 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0306036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2396  thiol:disulfide interchange protein  52.4 
 
 
280 aa  236  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.903284  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0719  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  48.54 
 
 
268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0660  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  48.54 
 
 
268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0646  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  48.54 
 
 
248 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0704  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  48.12 
 
 
248 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  0.0618042 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4182  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  44.93 
 
 
251 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2594  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  44.94 
 
 
255 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67724  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2396  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  39.84 
 
 
257 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000025188  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4241  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  44.49 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2031  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.24 
 
 
253 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1355  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  43.86 
 
 
257 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617458  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5854  protein-disulfide isomerase-like protein  44.38 
 
 
333 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0518  thiol:disulfide interchange protein DsbG  51.24 
 
 
141 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1397  Fis family transcriptional regulator  31.5 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0514  thiol:disulfide interchange protein DsbG  42.02 
 
 
122 aa  95.1  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1085  thiol:disulfide interchange domain protein  30.31 
 
 
274 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00153173  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1547  hypothetical protein  29.33 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1872  thiol:disulfide interchange protein, putative  29.33 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2228  hypothetical protein  30.99 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2246  dsbG domain protein  29.38 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1896  hypothetical protein  29.38 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.649573 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1057  hypothetical protein  30.63 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000413495  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1853  Fis family transcriptional regulator  34.04 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70818 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  27.37 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1615  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.68 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1943  dsbG domain protein  29.68 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2559  hypothetical protein  34.51 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.948214  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  29.26 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3811  hypothetical protein  29.63 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  30 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  30 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  30 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2560  hypothetical protein  29.41 
 
 
302 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2947  thiol:disulfide interchange protein DsbG, putative  29.15 
 
 
302 aa  62  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0452  hypothetical protein  34.48 
 
 
203 aa  62  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.912774  hitchhiker  0.000257257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0275  thiol:disulfide interchange domain protein  34.48 
 
 
203 aa  62  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.74 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  26.47 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1018  thiol:disulfide interchange domain protein  29.91 
 
 
182 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.977804  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.61 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  27.98 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  27.98 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  27.98 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2299  hypothetical protein  28.48 
 
 
399 aa  58.9  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.441757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  29.48 
 
 
245 aa  58.5  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1075  hypothetical protein  26.07 
 
 
372 aa  58.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00702033  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  26.32 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4214  hypothetical protein  24.11 
 
 
301 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000071573  normal  0.744992 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.41 
 
 
250 aa  55.8  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.14 
 
 
241 aa  55.8  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.17 
 
 
238 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  26.42 
 
 
242 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.4 
 
 
238 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.93 
 
 
237 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.64 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.64 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  26.42 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.5 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  26.42 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.55 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  24.08 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  25.91 
 
 
242 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3850  hypothetical protein  22.33 
 
 
354 aa  52.8  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.42 
 
 
238 aa  52.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.93 
 
 
245 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.93 
 
 
245 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.57 
 
 
242 aa  52.4  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.93 
 
 
242 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.93 
 
 
242 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.93 
 
 
242 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.93 
 
 
242 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.93 
 
 
242 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  26.74 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.41 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  23.56 
 
 
241 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.7 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  23.56 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2291  Ankyrin  35.34 
 
 
533 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>