72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3399 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3399  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 127 aa  262  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0880  4-oxalocrotonate tautomerase  53.54 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2646  acyloate catabolism-like protein  50.79 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3211  4-oxalocrotonate tautomerase  51.2 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00825864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4561  4-oxalocrotonate tautomerase  46.46 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0161169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2767  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4401  4-oxalocrotonate tautomerase  51.59 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.037596 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3113  4-oxalocrotonate tautomerase  44.8 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0509  4-oxalocrotonate tautomerase  46.03 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.380197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1736  4-oxalocrotonate tautomerase  48.03 
 
 		 127 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4668  4-oxalocrotonate tautomerase  46.03 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744907  normal  0.547814 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1663  4-oxalocrotonate tautomerase  47.24 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0155634  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2853  hypothetical protein  47.62 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4509  4-oxalocrotonate tautomerase  49.6 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0981308  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3855  4-oxalocrotonate tautomerase  49.6 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3672  4-oxalocrotonate tautomerase  49.6 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2211  4-oxalocrotonate tautomerase  46.46 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00393274  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4181  4-oxalocrotonate tautomerase  46.03 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.668909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2241  4-oxalocrotonate tautomerase  47.2 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280838  normal  0.0465075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3223  4-oxalocrotonate tautomerase  46.4 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3752  4-oxalocrotonate tautomerase  46.4 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317279  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0588  tautomerase enzyme family protein  44.88 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1472  4-oxalocrotonate tautomerase  44.88 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1669  4-oxalocrotonate tautomerase  44.88 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2571  tautomerase enzyme family protein  44.88 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2435  4-oxalocrotonate tautomerase  44.88 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119976  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0324  4-oxalocrotonate tautomerase  44.88 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0292  tautomerase enzyme family protein  44.88 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0873  tautomerase enzyme family protein  44.88 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4890  4-oxalocrotonate tautomerase  45.6 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100984  hitchhiker  0.0008433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2018  4-oxalocrotonate tautomerase  45.24 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.651181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3285  4-oxalocrotonate tautomerase  41.13 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3586  4-oxalocrotonate tautomerase  41.13 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398281  normal  0.0590497 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2038  hypothetical protein  37.69 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.247889  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0936  4-oxalocrotonate tautomerase  41.73 
 
 		 134 aa  100  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5441  hypothetical protein  37.3 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1756  hypothetical protein  36.15 
 
 		 135 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1974  hypothetical protein  35.38 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.213e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1939  hypothetical protein  35.38 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1799  hypothetical protein  35.38 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2017  hypothetical protein  35.38 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.333097  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0949  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0302  4-oxalocrotonate tautomerase  34.13 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5462  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0307831  normal  0.0551368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.08 
 
 		 244 aa  84.3  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1896  4-oxalocrotonate tautomerase  33.61 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1751  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00944027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0162  4-oxalocrotonate tautomerase  32.54 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1460  putative tautomerase  30.16 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4228  4-oxalocrotonate tautomerase  30.23 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8518  4-oxalocrotonate tautomerase  29.92 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2757  4-oxalocrotonate tautomerase  29.92 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2961  4-oxalocrotonate tautomerase  30.58 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2423  4-oxalocrotonate tautomerase  29.13 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0210887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1817  4-oxalocrotonate tautomerase  28.35 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200141 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5129  4-oxalocrotonate tautomerase  32.31 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3857  4-oxalocrotonate tautomerase  26.77 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00692492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2146  4-oxalocrotonate tautomerase  28.35 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.232573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2106  4-oxalocrotonate tautomerase  28.35 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501901 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6826  4-oxalocrotonate tautomerase  29.13 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.683318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4134  4-oxalocrotonate tautomerase  25.41 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7514  4-oxalocrotonate tautomerase  25.98 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6040  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.868812  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0609  tautomerase  23.97 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1717  hypothetical protein  24.59 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2286  4-oxalocrotonate tautomerase  31.73 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2485  4-oxalocrotonate tautomerase  45.45 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0880519 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0819  4-oxalocrotonate tautomerase  31.88 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2409  hypothetical protein  22.13 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125635  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0810  hypothetical protein  24.39 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2262  hypothetical protein  28.17 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  45.65 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>