More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2492 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2321  aldehyde dehydrogenase  82.09 
 
 		 539 aa  922    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3462  aldehyde dehydrogenase  57.38 
 
 		 542 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3443  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative  82.09 
 
 		 539 aa  922    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.381863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1033  aldehyde dehydrogenase  59.15 
 
 		 541 aa  682    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2516  Aldehyde Dehydrogenase  59.15 
 
 		 541 aa  675    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4059  aldehyde dehydrogenase  57.38 
 
 		 542 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.739878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2144  aldehyde dehydrogenase  56.24 
 
 		 546 aa  651    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2271  Aldehyde Dehydrogenase  56.56 
 
 		 541 aa  652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0315969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2492  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 541 aa  1109    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149114  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45780  Aldehyde dehydrogenase  81.61 
 
 		 459 aa  677    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2693  aldehyde dehydrogenase  57.93 
 
 		 542 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0789  aldehyde dehydrogenase  60.81 
 
 		 541 aa  684    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27210  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  82.44 
 
 		 541 aa  935    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49950  Aldehyde dehydrogenase  82.44 
 
 		 541 aa  932    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1707  Aldehyde Dehydrogenase_  56.8 
 
 		 539 aa  654    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.595433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2515  Aldehyde Dehydrogenase  56.98 
 
 		 539 aa  660    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1087  aldehyde dehydrogenase  61.8 
 
 		 540 aa  685    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2936  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  81.89 
 
 		 541 aa  890    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2493  aldehyde dehydrogenase  82.46 
 
 		 539 aa  926    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.442503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22040  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  82.33 
 
 		 534 aa  922    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2926  aldehyde dehydrogenase  82.5 
 
 		 539 aa  922    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5161  aldehyde dehydrogenase  57.38 
 
 		 569 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.664596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0301  gyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  59.44 
 
 		 545 aa  672    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1289  Aldehyde Dehydrogenase  56.56 
 
 		 541 aa  651    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.657181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5240  aldehyde dehydrogenase  57.56 
 
 		 542 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3408  aldehyde dehydrogenase  57.56 
 
 		 542 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.828845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34600  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  81.7 
 
 		 541 aa  892    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.204448 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0818  aldehyde dehydrogenase family protein  58.78 
 
 		 541 aa  625  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2859  aldehyde dehydrogenase  57.09 
 
 		 540 aa  622  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  55.08 
 
 		 536 aa  620  1e-176  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0798  Aldehyde Dehydrogenase  53.7 
 
 		 540 aa  616  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2068  aldehyde dehydrogenase  53.69 
 
 		 542 aa  615  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.72096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4869  aldehyde dehydrogenase  54.92 
 
 		 526 aa  605  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0146679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1385  Aldehyde Dehydrogenase  53.8 
 
 		 524 aa  596  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.354292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1780  Aldehyde Dehydrogenase  54.9 
 
 		 560 aa  596  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.760997 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54378  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  42.68 
 
 		 588 aa  411  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.41 
 
 		 479 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.41 
 
 		 479 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.11 
 
 		 477 aa  241  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 		 466 aa  240  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.18 
 
 		 479 aa  239  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.18 
 
 		 479 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.34 
 
 		 479 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.18 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  31.72 
 
 		 479 aa  237  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.18 
 
 		 479 aa  237  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.18 
 
 		 479 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.18 
 
 		 479 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  31.49 
 
 		 479 aa  234  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  33.57 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  31.65 
 
 		 471 aa  231  4e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  32.55 
 
 		 476 aa  221  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.34 
 
 		 482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  32.84 
 
 		 475 aa  216  7e-55  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  31.58 
 
 		 482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  30.98 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  31.86 
 
 		 472 aa  204  3e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  31.17 
 
 		 482 aa  200  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  29.48 
 
 		 477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2080  aldehyde dehydrogenase family protein  29.95 
 
 		 479 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.710123  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  27.17 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  28.35 
 
 		 477 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000636  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  29.08 
 
 		 506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2361  aldehyde dehydrogenase  30.2 
 
 		 683 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.202698 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3488  Aldehyde Dehydrogenase  27.93 
 
 		 489 aa  165  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  27.35 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  30.17 
 
 		 485 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1454  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  27.55 
 
 		 480 aa  162  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  26.9 
 
 		 498 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  27.42 
 
 		 490 aa  161  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0060  succinate semialdehyde dehydrogenase  27.66 
 
 		 507 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.455704  hitchhiker  0.00355427 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  28.99 
 
 		 481 aa  160  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2725  succinate semialdehyde dehydrogenase  29.07 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.774266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  28.8 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  30.05 
 
 		 533 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4061  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  27.68 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  30.79 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0509  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (acylating)  26.54 
 
 		 491 aa  159  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0997846  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5624  aldehyde dehydrogenase  30.79 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1663  aldehyde dehydrogenase  30.79 
 
 		 486 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1610  aldehyde dehydrogenase  30.79 
 
 		 486 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  28.39 
 
 		 482 aa  158  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1637  aldehyde dehydrogenase  30.79 
 
 		 486 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  30.79 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  30.79 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  29.09 
 
 		 482 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  30.79 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38450  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  28.66 
 
 		 486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  27.69 
 
 		 479 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4691  aldehyde dehydrogenase  27.69 
 
 		 486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  28.39 
 
 		 482 aa  157  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6645  aldehyde dehydrogenase  26.42 
 
 		 492 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2892  Aldehyde Dehydrogenase  29.95 
 
 		 461 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3157  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  28.9 
 
 		 484 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0316898 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  28.39 
 
 		 482 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  28.67 
 
 		 476 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3141  aldehyde dehydrogenase  28.9 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  28.36 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3193  aldehyde dehydrogenase  28.54 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4370  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  27 
 
 		 485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>