24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1557 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1557  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  244  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1553  hypothetical protein  97.46 
 
 		 124 aa  237  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00238513  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3185  hypothetical protein  83.05 
 
 		 128 aa  204  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0769435  hitchhiker  0.00869472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1963  hypothetical protein  61.54 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2911  hypothetical protein  61.54 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0641  hypothetical protein  57.26 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4578  hypothetical protein  51.28 
 
 		 122 aa  123  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1329  hypothetical protein  53.66 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1994  hypothetical protein  51.97 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5257  hypothetical protein  52.14 
 
 		 119 aa  120  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3476  hypothetical protein  51.64 
 
 		 123 aa  120  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0693193  decreased coverage  0.00711492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2425  hypothetical protein  49.15 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3182  hypothetical protein  51.24 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0434278  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3815  hypothetical protein  51.67 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.51553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2291  hypothetical protein  51.24 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.117082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1832  hypothetical protein  53.21 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2380  hypothetical protein  47.15 
 
 		 127 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0727  hypothetical protein  46.34 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0817  hypothetical protein  47.5 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4660  hypothetical protein  46.67 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1831  hypothetical protein  44.44 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4445  hypothetical protein  38.1 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5562  hypothetical protein  39.32 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0734  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26257  normal  0.126132 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>