16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1168 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1168  tail fiber protein, putative  100 
 
 		 306 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3731  tail fiber protein, putative  38.57 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1166  hypothetical protein  48.2 
 
 		 364 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1170  carbohydrate-binding, CenC-like  62.96 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1164  hypothetical protein  66.18 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  32.7 
 
 		 419 aa  99  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2748  hypothetical protein  37.19 
 
 		 527 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  28.45 
 
 		 714 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  33.51 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  30.69 
 
 		 238 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  38.18 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  38.18 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  37.29 
 
 		 492 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2015  hypothetical protein  38.89 
 
 		 168 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  40.82 
 
 		 519 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1303  hypothetical protein  39.73 
 
 		 200 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.616421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>