15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0761 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0761  protein of unknown function DUF1593  100 
 
 
488 aa  1005    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2125  protein of unknown function DUF1593  47.38 
 
 
477 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2156  hypothetical protein  45.66 
 
 
462 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0754544 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  42.98 
 
 
1507 aa  360  3e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0565  signal peptide and transmembrane prediction  41.19 
 
 
478 aa  349  5e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390373  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6073  protein of unknown function DUF1593  42.92 
 
 
474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2122  hypothetical protein  42.77 
 
 
492 aa  330  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.526696  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3215  hypothetical protein  39.25 
 
 
498 aa  330  5.0000000000000004e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  36.53 
 
 
933 aa  292  8e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0873  hypothetical protein  28.17 
 
 
493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.390345  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00550  protein of unknown function (DUF1593) with cadherin domain  30.04 
 
 
480 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2806  protein of unknown function DUF1593  34.17 
 
 
431 aa  143  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.1118  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07383  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 
505 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3874  hypothetical protein  30.21 
 
 
787 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3136  hypothetical protein  29.91 
 
 
787 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>